195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1128 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1128  HAD family hydrolase  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.893823  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.29 
 
 		 219 aa  191  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3093  hypothetical protein  42.31 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3384  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 206 aa  132  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  33.99 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  33.99 
 
 		 203 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  31.31 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  28.08 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  30.73 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0900  HAD family hydrolase  23.53 
 
 		 196 aa  102  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  34.76 
 
 		 203 aa  96.3  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.84 
 
 		 199 aa  95.5  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  28.23 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  30.58 
 
 		 202 aa  91.7  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  27.88 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  29.65 
 
 		 199 aa  85.9  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.86 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  28.38 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1926  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.24 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6895  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.69 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.97 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00913759  normal  0.088603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2669  HAD family hydrolase  30.73 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  32.87 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.16 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.92 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.286753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0542  HAD family hydrolase  36.63 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0173803  normal  0.811025 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0053  HAD family hydrolase  29.95 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2715  HAD family hydrolase  27.08 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  32.5 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0706  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.95 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1967  putative HAD superfamily hydrolase  24.76 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0600927  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  26.96 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.99 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2528  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  27.94 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0524  putative HAD superfamily hydrolase  26.67 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0488  HAD family hydrolase  30.99 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2925  HAD-superfamily hydrolase  31.34 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  32.71 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  30.1 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0446  HAD family hydrolase  30.52 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.230544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3116  HAD family hydrolase  35.54 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.441667 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2588  HAD family hydrolase  30.52 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0516  HAD family hydrolase  30.52 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.374792  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0848  HAD hydrolase, family IA, variant 3  26.94 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0509  HAD-superfamily hydrolase  33.02 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3596  hydrolase  33.02 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.623468  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  29.38 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0669  HAD family hydrolase  33.02 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0965  HAD family hydrolase  33.02 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171916  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3582  HAD family hydrolase  33.02 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.548756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3607  HAD family hydrolase  33.02 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1935  HAD family hydrolase  33.02 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729707  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0420  HAD family hydrolase  29.86 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.802184  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2882  HAD family hydrolase  30.05 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0448644  normal  0.225863 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3603  HAD family hydrolase  30.52 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.72 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1090  hydrolase  25.94 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  25.82 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0764  HAD family hydrolase  40 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.523693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.93 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2256  HAD family hydrolase  28.65 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00707302  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.69 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0496  HAD superfamily hydrolase  33.66 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0572  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112395  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  26.21 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0492  HAD superfamily hydrolase  32.67 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  27.62 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2325  HAD family hydrolase  27.62 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0606  HAD family hydrolase  29.52 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49461  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  26.19 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4524  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.67 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655556  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3489  HAD family hydrolase  30.56 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  34.83 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0350  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.373549  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  32.98 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  27.06 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.21 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.92 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4073  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  28.97 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.358464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  22.64 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4647  HAD family phosphatase  26.32 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0723  HAD family hydrolase  30.14 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0874  HAD family hydrolase  26.42 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.12893  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2946  HAD family hydrolase  29.37 
 
 		 378 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.913197  normal  0.0128991 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  44 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  24.88 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.1 
 
 		 298 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  28.85 
 
 		 133 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.7 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  44 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  23.2 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4195  HAD family hydrolase  29.55 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.09 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.62 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0532  HAD superfamily hydrolase-like protein  24.77 
 
 		 163 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>