142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0725 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0725  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.39 
 
 		 204 aa  115  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.55 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1005  HAD family hydrolase  31.19 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.10158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0096  HAD superfamily hydrolase  31.55 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000147851  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  28.87 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.05 
 
 		 216 aa  89.4  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.95 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  28.42 
 
 		 203 aa  81.3  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.84 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  28.49 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  27.87 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  28.42 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12718  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.12 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  28.06 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  29.53 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.32 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0053  HAD family hydrolase  29.19 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  24.59 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0900  HAD family hydrolase  26.06 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  24.59 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  24.59 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3453  HAD family hydrolase  28.27 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  27.75 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.42 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  27.37 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.72 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  25 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  25 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  27.78 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  25 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  25 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  25 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  25 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  25 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  25 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  25 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  30.53 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.39 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  24.12 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2669  HAD family hydrolase  26.13 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  25.81 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0579  HAD-superfamily hydrolase  26.6 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1855  HAD family hydrolase  26.6 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0888  HAD-superfamily hydrolase  26.6 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1918  HAD family hydrolase  26.6 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2011  HAD-superfamily hydrolase  26.6 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  25 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6628  HAD family hydrolase  23.92 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563326  normal  0.0579332 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  29.32 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  22.78 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  22.78 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  22.78 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  22.78 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  22.78 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0436  HAD-superfamily hydrolase  26.6 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  24.87 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1667  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0663843 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  26.6 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  24.3 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1265  HAD family hydrolase  25.27 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1742  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0641396  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  24.08 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1892  HAD family hydrolase  22.64 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.606117  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.13 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.86 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4019  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.4 
 
 		 232 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0842123  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  41.07 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0979  HAD-superfamily hydrolase  24.87 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.97 
 
 		 133 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3215  HAD superfamily hydrolase  23.94 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  24.48 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  27.14 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4184  HAD family hydrolase  23.96 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.04 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21780  predicted HAD superfamily hydrolase  31.82 
 
 		 244 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000727615  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  25 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  25.53 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  25.38 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  31.29 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  24.63 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  23.66 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.32 
 
 		 250 aa  45.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.56 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1551  HAD family hydrolase  30.19 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.27 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.66 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  23.19 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0848  HAD hydrolase, family IA, variant 3  28.19 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.18 
 
 		 220 aa  45.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.48 
 
 		 219 aa  45.1  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0572  HAD family hydrolase  24.74 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112395  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.39 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4154  phosphatase  22.42 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  25 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4524  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655556  normal  0.0295033 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>