58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3215 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3215  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 216 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1787  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  49.75 
 
 		 218 aa  205  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.170193 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0394  hydrolase  40.7 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.778884 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0572  HAD family hydrolase  42.49 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112395  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1742  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.24 
 
 		 204 aa  154  7e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0641396  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2946  HAD family hydrolase  39.38 
 
 		 378 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.913197  normal  0.0128991 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1023  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.06 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.4 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  24.88 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  26.37 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.48 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  22.6 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1005  HAD family hydrolase  23.71 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.10158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.5 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  25.65 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.2 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  25.53 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.76 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1292  HAD family hydrolase  32.56 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4524  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.69 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655556  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.53 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.93 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_002950  PG0725  HAD superfamily hydrolase  23.94 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  26.06 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  26.06 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  26.06 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0096  HAD superfamily hydrolase  23.59 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000147851  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.06 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  26.06 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  26.06 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.06 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  24.08 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  23.37 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  25.53 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  25.53 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  25.53 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.31 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  31.71 
 
 		 215 aa  45.4  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  23.37 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  30.84 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  23.37 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3587  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.6 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0887  HAD family hydrolase  31.46 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3093  hypothetical protein  27.61 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3961  HAD family hydrolase  24.29 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  24.26 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6628  HAD family hydrolase  22.73 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.563326  normal  0.0579332 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0532  HAD superfamily hydrolase-like protein  25 
 
 		 163 aa  42.4  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.32 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.68 
 
 		 267 aa  42  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.32 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3812  HAD family hydrolase  24.42 
 
 		 227 aa  42  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1694  HAD superfamily hydrolase  20.94 
 
 		 224 aa  42  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  26.52 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  25.25 
 
 		 201 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0030  HAD family phosphatase  26.58 
 
 		 213 aa  41.6  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>