267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3290 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
200 aa  395  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02292  hydrolase  52.26 
 
 
205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1265  HAD family hydrolase  40.33 
 
 
204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489087  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3453  HAD family hydrolase  36.84 
 
 
204 aa  111  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0979  HAD-superfamily hydrolase  36.68 
 
 
204 aa  104  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0436  HAD-superfamily hydrolase  39.11 
 
 
268 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0888  HAD-superfamily hydrolase  39.11 
 
 
217 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0579  HAD-superfamily hydrolase  39.11 
 
 
204 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1918  HAD family hydrolase  39.11 
 
 
217 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1855  HAD family hydrolase  39.11 
 
 
204 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2011  HAD-superfamily hydrolase  39.11 
 
 
204 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.27 
 
 
204 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  32.09 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  31.37 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  31.02 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.64 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  29.95 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  29.73 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.57 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  27.81 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  27.81 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
212 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  27.81 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  26.74 
 
 
199 aa  62  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  26.74 
 
 
199 aa  61.6  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  26.74 
 
 
199 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  32.14 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.14 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  32.14 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  32.14 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  32.14 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  32.14 
 
 
199 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.57 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1005  HAD family hydrolase  27.05 
 
 
209 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.10158  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  27.18 
 
 
231 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  26.15 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.11 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2458  HAD family hydrolase  28.35 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.279583 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  51.72 
 
 
224 aa  55.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  30.1 
 
 
217 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  31.94 
 
 
240 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  25.5 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  33.06 
 
 
242 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  30.63 
 
 
203 aa  55.5  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  26.7 
 
 
203 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  23.98 
 
 
230 aa  55.1  0.0000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.3 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  28.4 
 
 
214 aa  53.9  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  31.94 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  36.04 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  28.57 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  27.91 
 
 
233 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  27.93 
 
 
260 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  28.57 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  28.57 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  28.57 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  32.99 
 
 
211 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  28.57 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  34.02 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  30.11 
 
 
217 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  34.02 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  27.81 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.53 
 
 
298 aa  53.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0542  HAD family hydrolase  34.55 
 
 
219 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0173803  normal  0.811025 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  29.73 
 
 
228 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.29 
 
 
211 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.64 
 
 
208 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  48.44 
 
 
255 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.84 
 
 
228 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  31.48 
 
 
200 aa  52.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  30.48 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  29.41 
 
 
228 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  29.41 
 
 
244 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0470  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  40.78 
 
 
219 aa  52  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  29.41 
 
 
244 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  24.44 
 
 
199 aa  51.6  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  36.79 
 
 
235 aa  51.6  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.53 
 
 
211 aa  51.6  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.68 
 
 
200 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.55 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4019  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.93 
 
 
232 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0842123  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  28.86 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2528  HAD family hydrolase  37.23 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.08 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  25.41 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.63 
 
 
228 aa  50.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  41.38 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  30.53 
 
 
252 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  32.99 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  38.6 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2946  HAD family hydrolase  25.12 
 
 
378 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.913197  normal  0.0128991 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0645  epoxide hydrolase-like phosphatase  31.78 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  23.94 
 
 
205 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  25.13 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3728  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.62 
 
 
224 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  31.11 
 
 
224 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1090  hydrolase  41.94 
 
 
202 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.07 
 
 
133 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1190  hypothetical protein  25.81 
 
 
204 aa  48.9  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>