97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3453 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3453  HAD family hydrolase  100 
 
 		 204 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1265  HAD family hydrolase  70.59 
 
 		 204 aa  292  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  70.1 
 
 		 204 aa  274  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0888  HAD-superfamily hydrolase  67.98 
 
 		 217 aa  271  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1918  HAD family hydrolase  67.98 
 
 		 217 aa  271  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0579  HAD-superfamily hydrolase  67.98 
 
 		 204 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1855  HAD family hydrolase  67.98 
 
 		 204 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2011  HAD-superfamily hydrolase  67.49 
 
 		 204 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0436  HAD-superfamily hydrolase  67.49 
 
 		 268 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0979  HAD-superfamily hydrolase  64.71 
 
 		 204 aa  260  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02292  hydrolase  38.34 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.39 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  28.65 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  30 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  31.32 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0725  HAD superfamily hydrolase  28.27 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.05 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  32.47 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  29.74 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.74 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1288  HAD family hydrolase  30.39 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.888389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  25 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.04 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  27.98 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.29 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  27.07 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  27.07 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  27.07 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  26 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  27.07 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  27.07 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.15 
 
 		 291 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.37 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.978388 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  39.24 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.57 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.48 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  27.48 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  25.33 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  25.33 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  27.48 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  25.33 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  27.48 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  27.48 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  27.48 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  27.63 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  25.68 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.52 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1667  HAD family hydrolase  27.18 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0663843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0142  HAD family hydrolase  25.13 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  28.87 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  27.18 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  23.19 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.06 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  31.86 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2458  HAD family hydrolase  26.4 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.279583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2108  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.04 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.26 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.2 
 
 		 233 aa  48.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  25.33 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  25.33 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0524  putative HAD superfamily hydrolase  28.43 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172538  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  25.12 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  26.27 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  25.33 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  27.1 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  26.36 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  36.71 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.2 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.79 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  28.43 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.32 
 
 		 298 aa  45.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  29.21 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0706  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.41 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.73 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0532  HAD superfamily hydrolase-like protein  26.62 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  25.24 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_004310  BR0492  HAD superfamily hydrolase  38.98 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0848  HAD hydrolase, family IA, variant 3  28.12 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0606  HAD family hydrolase  37.29 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49461  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  37.1 
 
 		 133 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0496  HAD superfamily hydrolase  38.98 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.1 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.542403  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.52 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.286753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0542  HAD family hydrolase  25.37 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0173803  normal  0.811025 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3556  HAD family hydrolase  28.32 
 
 		 262 aa  42.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0096  HAD superfamily hydrolase  22.96 
 
 		 207 aa  42  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000147851  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  25.81 
 
 		 240 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3640  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.5 
 
 		 214 aa  42  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6303  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.38 
 
 		 133 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  25.81 
 
 		 240 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1128  HAD family hydrolase  26.85 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.893823  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.77 
 
 		 212 aa  41.2  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>