147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1005 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1005  HAD family hydrolase  100 
 
 
209 aa  425  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.10158  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.31 
 
 
204 aa  166  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.32 
 
 
216 aa  155  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0096  HAD superfamily hydrolase  36.87 
 
 
207 aa  135  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000147851  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.5 
 
 
211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.17 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  33.67 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  32.52 
 
 
231 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.65 
 
 
217 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.93 
 
 
208 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0725  HAD superfamily hydrolase  31.19 
 
 
208 aa  100  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  29.95 
 
 
208 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.72 
 
 
209 aa  88.6  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  29.57 
 
 
199 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.57 
 
 
199 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  29.57 
 
 
199 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  29.57 
 
 
199 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  29.57 
 
 
199 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  29.57 
 
 
199 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  29.57 
 
 
199 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  29.57 
 
 
199 aa  79  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  24.62 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  29.03 
 
 
199 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  29.31 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2458  HAD family hydrolase  29.95 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.279583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  26.67 
 
 
198 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  26.63 
 
 
199 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  26.63 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  26.63 
 
 
199 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  26.63 
 
 
199 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  26.63 
 
 
199 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  25 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  24.62 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  24.62 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  24.62 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  24.62 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12718  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.6 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  27.03 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  28.29 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4154  phosphatase  26.67 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  25.13 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.73 
 
 
202 aa  62.4  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.94 
 
 
204 aa  62.4  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.81 
 
 
203 aa  62  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.18 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
200 aa  55.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  26.21 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0570  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  26.83 
 
 
214 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.457347  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3093  hypothetical protein  29.03 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  21.74 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  26.89 
 
 
234 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  25 
 
 
203 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3215  HAD superfamily hydrolase  23.71 
 
 
216 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1742  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25 
 
 
204 aa  52.4  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0641396  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06091  hypothetical protein  42.59 
 
 
205 aa  52.4  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  23.41 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.38 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  25 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1146  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.76 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  45.45 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4067  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  24.88 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144005  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02292  hydrolase  23.74 
 
 
205 aa  49.3  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1973  epoxide hydrolase  23.22 
 
 
212 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0441  putative L-2-haloalkanoic acid dehalogenase (HAD aspartate-nucleophile hydrolase)  23.67 
 
 
207 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238349  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  25.47 
 
 
210 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.59 
 
 
199 aa  48.5  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.4 
 
 
216 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  25.38 
 
 
200 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  29.29 
 
 
243 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.9 
 
 
231 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  21.88 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.94 
 
 
211 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.044759 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.26 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0164  HAD family hydrolase  40.68 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1551  HAD family hydrolase  27.13 
 
 
224 aa  45.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3350  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.09 
 
 
205 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0572  HAD family hydrolase  21.47 
 
 
207 aa  45.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112395  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.17 
 
 
267 aa  45.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0542  HAD family hydrolase  51.22 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0173803  normal  0.811025 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  37.04 
 
 
202 aa  45.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  28.83 
 
 
205 aa  45.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4195  HAD family hydrolase  38.98 
 
 
220 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0160  HAD family hydrolase  38.98 
 
 
220 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  24.88 
 
 
216 aa  45.1  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3517  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.64 
 
 
207 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00913759  normal  0.088603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  35 
 
 
255 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0470  HAD-superfamily hydrolase, phosphatase  27 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  26.05 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3556  HAD family hydrolase  38.33 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  30.16 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0900  HAD family hydrolase  19.71 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.86 
 
 
291 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  23.94 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0848  HAD hydrolase, family IA, variant 3  42.5 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  23.94 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0524  putative HAD superfamily hydrolase  25.13 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  23.94 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.51 
 
 
298 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  36.67 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>