275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1551 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1551  HAD family hydrolase  100 
 
 
224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  29.15 
 
 
222 aa  95.5  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  29.17 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5409  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.59 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3178  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.95 
 
 
230 aa  82  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00001464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  27.98 
 
 
292 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  28.7 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  30.47 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  29.83 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  30.96 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
255 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  33.11 
 
 
225 aa  62  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  25.78 
 
 
241 aa  62  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  23.05 
 
 
258 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  32.38 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  31.25 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1762  HAD superfamily hydrolase  33.08 
 
 
239 aa  58.9  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0794121  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
243 aa  59.3  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.76 
 
 
248 aa  58.9  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.97 
 
 
251 aa  58.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.67 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2484  HAD family hydrolase  39.51 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  33.05 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  29.52 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  31.63 
 
 
245 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  31.79 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30 
 
 
230 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  32.67 
 
 
230 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  28.87 
 
 
233 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  29.11 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  29.09 
 
 
255 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  31.79 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  28.57 
 
 
208 aa  55.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32 
 
 
230 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  30.4 
 
 
242 aa  55.5  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  31 
 
 
231 aa  55.1  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.43 
 
 
228 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  31 
 
 
231 aa  55.1  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  31 
 
 
230 aa  55.1  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  31.36 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  29.55 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  24.24 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  32.97 
 
 
228 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  31.34 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  27.71 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  26.34 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  30.3 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  29.55 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  28.79 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  30.61 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.71 
 
 
232 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  29.7 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  29.2 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.9 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  27.69 
 
 
233 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  27.69 
 
 
233 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  26.96 
 
 
235 aa  52.8  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0784  HAD-superfamily hydrolase  35.06 
 
 
216 aa  52.4  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1511  HAD family hydrolase  29.06 
 
 
203 aa  52.4  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  29.63 
 
 
216 aa  52  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  28.8 
 
 
227 aa  52  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  27.94 
 
 
272 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  30.93 
 
 
234 aa  52  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2691  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.13 
 
 
212 aa  51.6  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  29.17 
 
 
196 aa  51.6  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  27.13 
 
 
234 aa  51.6  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  29.17 
 
 
196 aa  51.6  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  25.25 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.25 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  25.25 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  25.25 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  25.25 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  32.29 
 
 
243 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  28.03 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  25.25 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  25.25 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  24.81 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  25.25 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  24.83 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  25.25 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  29.17 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.71 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0708331 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  28.03 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  28.03 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  27.37 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.53 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  29.6 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  25.77 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.63 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.77 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  29.6 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  28.03 
 
 
216 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  26.04 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  28.03 
 
 
216 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
225 aa  49.7  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  25.51 
 
 
203 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1984  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.33 
 
 
181 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.911586  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.5 
 
 
211 aa  49.3  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  26.47 
 
 
272 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.07 
 
 
233 aa  49.3  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>