More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2295 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 234 aa  472  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  36.28 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  37.17 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  35.21 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  33.63 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  32.14 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.04 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.29 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.63 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  32.74 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  32.74 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  30.77 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  32.8 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  30.89 
 
 		 228 aa  72  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  29.22 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  33.9 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  30.77 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  30.07 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  26.71 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  32.54 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  30.07 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.07 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  31.21 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.23 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  35.77 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  29.92 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  31.2 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  29.13 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  32 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  26.42 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  28.67 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.55 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  30.95 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  30.4 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.47 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  24.68 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  30.4 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0796  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  32 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  29.6 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  27.5 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  28.38 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  35.96 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.85 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3213  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.05 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3072  HAD family hydrolase  24.15 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  23.56 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1687  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.91 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0106556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5158  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.82 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.0266654 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  30.53 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  29.58 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.45 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  28.49 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.03 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  30.09 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.77 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  30.93 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0589  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.11 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1799  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  37.21 
 
 		 259 aa  62  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.375671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.3 
 
 		 268 aa  62  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5662  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 349 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  23.11 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  26.83 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  28.15 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  29.92 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  23.02 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  27.43 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  28 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  27.66 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  27.66 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.73 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3367  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.15 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  27.66 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  27.66 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  27.66 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  29.37 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  29.37 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  25.83 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.03 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0046  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.41 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  24.52 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.39 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.71 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  25.83 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  28.12 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  31.78 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.09 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  25.14 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  30.69 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  28.37 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  28.37 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  26.57 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  29.37 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.37 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  26.57 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  26.57 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  26 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  29.37 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  29.37 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>