More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5158 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5158  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
222 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.0266654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.09 
 
 
250 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.93 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0046  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.24 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.49 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  37.86 
 
 
225 aa  86.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  28.14 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  30.6 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  30.6 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  30.6 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  30.6 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  30.6 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  35 
 
 
225 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  35 
 
 
225 aa  82  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  35 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  35 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  28 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  35 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  35 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  35 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  27.64 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  27.64 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  35.19 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  29.06 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  35 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  31.25 
 
 
255 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  30.14 
 
 
224 aa  79  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3145  HAD superfamily hydrolase  32.79 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.92 
 
 
230 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3132  HAD superfamily hydrolase  32.79 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3039  HAD superfamily hydrolase  32.52 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0500536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3392  HAD superfamily hydrolase  32.79 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3072  HAD family hydrolase  33.61 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3367  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.79 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3362  HAD superfamily hydrolase  32.79 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0552975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.79 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3346  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.79 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  26.7 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  30 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1884  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.9 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  27.86 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  32.76 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  26.7 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  41.18 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  30.73 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.75 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  26.7 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  26.7 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  26.18 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  28.76 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  28.84 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  29.33 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  26.7 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  26.18 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  32.06 
 
 
228 aa  72  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  32.8 
 
 
239 aa  72  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  32.8 
 
 
239 aa  72  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  72  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  36.07 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  34.65 
 
 
229 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.18 
 
 
224 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  36.07 
 
 
238 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  36.07 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  32.54 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  36.89 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  23.9 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  36.52 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  33.79 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  35.65 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  32.19 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.16 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0497866  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.72 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  32.19 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  27.36 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  34.78 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  31.76 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  31.76 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  26.76 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  31.76 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3750  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.59 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  24.89 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  28.97 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  24.57 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  28.21 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  26.03 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  33.33 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.05 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.46 
 
 
231 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  25.11 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  30.61 
 
 
224 aa  63.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.45 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  23.79 
 
 
231 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5260  HAD superfamily hydrolase  23.71 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5658  HAD superfamily hydrolase  23.71 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  29.82 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  27.96 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>