More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5456 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
217 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0046  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  53.05 
 
 
216 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.27 
 
 
250 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5158  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.93 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.0266654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44.75 
 
 
221 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.58 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  32.49 
 
 
245 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  31.92 
 
 
245 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  32.86 
 
 
238 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  30.14 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  31.98 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  31.98 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  31.13 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  32.37 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  32.35 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  31.13 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  29.72 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  36.57 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  40.43 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  30.05 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  31.6 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  30.33 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.65 
 
 
217 aa  72  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  38.39 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  38.39 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  38.39 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  38.39 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  38.39 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  42.16 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  24.34 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  29.81 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  29.81 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  27.52 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  29.81 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  25.81 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  35.66 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.32 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  23.89 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  24.11 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  24.42 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  25.81 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.35 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  27.13 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  27.73 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.11 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  30.93 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  29.86 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.86 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  23.89 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3213  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.26 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  29.86 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  29.86 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  23.89 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.87 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3292  HAD family hydrolase  34.13 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125933 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  29.86 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3065  HAD family hydrolase  34.73 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  29.86 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  35.2 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  36.61 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  24.07 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  21.76 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  25.55 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.38 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  37.5 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  36.61 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  36.61 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  23.61 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  30.57 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  23.9 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.11 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5202  HAD family hydrolase  26.34 
 
 
231 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  25.11 
 
 
231 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  24.54 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3521  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.33 
 
 
234 aa  64.3  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  33.85 
 
 
234 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  29.5 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  22.32 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.21 
 
 
227 aa  63.2  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0765  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.51 
 
 
236 aa  63.2  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.64 
 
 
222 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  21.93 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.92 
 
 
231 aa  62.8  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  37.62 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  31.86 
 
 
233 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3362  HAD superfamily hydrolase  25.82 
 
 
236 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0552975  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.04 
 
 
227 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  31.86 
 
 
233 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3072  HAD family hydrolase  24.66 
 
 
236 aa  62.8  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  25.13 
 
 
223 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1884  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.67 
 
 
236 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.6 
 
 
230 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.77 
 
 
231 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.65 
 
 
236 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5260  HAD superfamily hydrolase  24.67 
 
 
231 aa  61.6  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5658  HAD superfamily hydrolase  24.67 
 
 
231 aa  61.6  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.84 
 
 
232 aa  61.6  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  24.6 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>