268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3065 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3065  HAD family hydrolase  100 
 
 		 214 aa  417  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3292  HAD family hydrolase  88.29 
 
 		 214 aa  323  9e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.5 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0046  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.56 
 
 		 216 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.26 
 
 		 250 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.52 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5158  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.74 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.0266654 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  27.98 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.21 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  25.69 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  31.78 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  25.69 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  31.78 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 225 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.78 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  31.37 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  26.15 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  25.81 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  30 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.15 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  25.35 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.78 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  25.35 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  25.35 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  38.61 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  38.61 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  38.61 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  38.61 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  38.61 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  29.91 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  33.33 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  29.91 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  34.23 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  39.6 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  41.18 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  39.6 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  39.6 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.6 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  39.6 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  39.6 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  39.6 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  39.6 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  30.65 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.76 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  38.61 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  32.91 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  36.89 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  33.66 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  27.07 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.88 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  25.11 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  24.34 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5202  HAD family hydrolase  27.93 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.34 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  24.07 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  24.77 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  37.84 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  28.28 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.62 
 
 		 260 aa  62  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  35 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  40.96 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  31.43 
 
 		 128 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5260  HAD superfamily hydrolase  23.15 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5658  HAD superfamily hydrolase  23.15 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  23.89 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.89 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  34.65 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.87 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  34.65 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  35.71 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  27.1 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  30.69 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  40.48 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  25.74 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.89 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.54 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  29.59 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  33.33 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  33.33 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  33.33 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  37.66 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  32.67 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  33.33 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  37.66 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3072  HAD family hydrolase  23.79 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3362  HAD superfamily hydrolase  25.21 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0552975  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  36.9 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3039  HAD superfamily hydrolase  23.14 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0500536  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  32.97 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  41 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  36.25 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3132  HAD superfamily hydrolase  23.14 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  36.25 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  36.25 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.14 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3750  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.33 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>