228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3213 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3213  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 
225 aa  466  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3254  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.55 
 
 
237 aa  167  9e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  40.18 
 
 
227 aa  149  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0589  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40 
 
 
224 aa  148  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0754  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.44 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3819  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.29 
 
 
251 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0765  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.45 
 
 
236 aa  134  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.56 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0497866  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0422  HAD family hydrolase  31.77 
 
 
217 aa  95.1  8e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0639  HAD family hydrolase  32.8 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0512419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5662  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.95 
 
 
349 aa  85.5  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342758 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.75 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.899574  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  27.85 
 
 
225 aa  74.7  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  28.07 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1936  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.69 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0085  HAD family hydrolase  26.61 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.658322  hitchhiker  0.00000571122 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  26.91 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  26.94 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.26 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.72 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  27.62 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0922  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.37 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  30.08 
 
 
292 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  26.05 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.54 
 
 
251 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.81 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  27.13 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  26.06 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  29.17 
 
 
224 aa  58.5  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.44 
 
 
237 aa  58.5  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.845236  normal  0.047743 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1992  hydrolase  28.23 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.360933  decreased coverage  0.00169391 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00240  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.54 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  28.83 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  28.12 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.96 
 
 
231 aa  57  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.39 
 
 
250 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.13 
 
 
223 aa  55.8  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 
225 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.34 
 
 
222 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  25.11 
 
 
258 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  27.98 
 
 
226 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  28.12 
 
 
224 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.12 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  28.12 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.9 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  27.97 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  27.97 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  28.12 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  27.89 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1799  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  26.29 
 
 
259 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.375671  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  24.62 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  25.37 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  28.1 
 
 
247 aa  52.8  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  28.12 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2065  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.71 
 
 
217 aa  52.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0370396  normal  0.164629 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  29.67 
 
 
128 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  25.38 
 
 
231 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  23.98 
 
 
229 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  29.32 
 
 
222 aa  52.4  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  26.57 
 
 
242 aa  51.6  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6497  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.92 
 
 
234 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121747  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.28 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0577  HAD family hydrolase  26.39 
 
 
216 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  24.89 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  27.88 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1707  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.81 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  25.32 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  24.23 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  25.89 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3521  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.33 
 
 
234 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.81 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.17 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  24.35 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  25.83 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  27.03 
 
 
221 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  31.09 
 
 
255 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  21.5 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.68 
 
 
229 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  27.56 
 
 
241 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  25.22 
 
 
218 aa  49.3  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  26.91 
 
 
229 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  29.41 
 
 
228 aa  49.3  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5158  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.06 
 
 
222 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.0266654 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0739  hydrolase  27.47 
 
 
230 aa  48.5  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.715617 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  23.5 
 
 
215 aa  48.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 
239 aa  48.5  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2188  HAD family hydrolase  28.74 
 
 
220 aa  48.5  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  27.23 
 
 
229 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  28.71 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  27.14 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  26.42 
 
 
300 aa  47.8  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  22.94 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.23 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0046  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.5 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.69 
 
 
227 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.28 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0750  hydrolase  27.52 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>