247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3336 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
251 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  55.22 
 
 
243 aa  227  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3196  HAD family hydrolase  51.72 
 
 
237 aa  219  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1176  HAD family hydrolase  39.15 
 
 
337 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00246579  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  29.44 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  35.54 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1762  HAD superfamily hydrolase  30.43 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0794121  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  30.87 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  30.33 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  24.9 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  28.67 
 
 
225 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0796  HAD family hydrolase  29.58 
 
 
231 aa  62.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3213  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.54 
 
 
225 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1937  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.66 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.612743  normal  0.0123866 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  22.77 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.58 
 
 
204 aa  60.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  27.4 
 
 
234 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0754  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.3 
 
 
223 aa  59.7  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35120  haloacid dehalogenase superfamily protein  31.16 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1878  HAD superfamily hydrolase  23.08 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0128231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  34.27 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1551  HAD family hydrolase  23.97 
 
 
224 aa  56.6  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  28.21 
 
 
225 aa  57  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  24.26 
 
 
223 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3103  HAD family hydrolase  32.14 
 
 
562 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.43 
 
 
230 aa  56.2  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1992  hydrolase  24.68 
 
 
254 aa  56.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.360933  decreased coverage  0.00169391 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  23.97 
 
 
223 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3819  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.82 
 
 
251 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1323  HAD family hydrolase  27.55 
 
 
269 aa  55.8  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00954891  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  27.5 
 
 
205 aa  55.8  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  28.67 
 
 
227 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0129  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.65 
 
 
543 aa  55.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.61 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.35 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.93 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.899574  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.58 
 
 
583 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  28.21 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  26.52 
 
 
234 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5409  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.76 
 
 
267 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  29.6 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5662  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.49 
 
 
349 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.68 
 
 
230 aa  53.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3178  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.56 
 
 
230 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00001464  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1720  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.24 
 
 
209 aa  52.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00306678  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3459  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.72 
 
 
216 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0737  HAD family hydrolase  35.29 
 
 
230 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421268  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0751  HAD family hydrolase  35.29 
 
 
230 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.170461 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1153  HAD family hydrolase  25.51 
 
 
252 aa  52.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.94325 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0731  HAD family hydrolase  35.29 
 
 
230 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  26.72 
 
 
225 aa  52.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  23.85 
 
 
224 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  28.97 
 
 
224 aa  52  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  26.15 
 
 
234 aa  52  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  29.29 
 
 
224 aa  52  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  31.25 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.25 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  23.28 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  31.25 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  31.25 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.51 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  31.25 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3360  HAD family hydrolase  27.93 
 
 
251 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000863998  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  31.25 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  31.25 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  28.74 
 
 
219 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  31.25 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.59 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0922  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 
219 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  31.25 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  31.03 
 
 
133 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  24.27 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1773  hydrolase  28.87 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.672363 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.33 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0497866  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0352  HAD family hydrolase  30.39 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.584229  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  30.19 
 
 
226 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.87 
 
 
222 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2255  HAD family hydrolase  37.63 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  0.797248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.92 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0085  HAD family hydrolase  30.69 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.658322  hitchhiker  0.00000571122 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.09 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.18 
 
 
224 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  32.41 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  26.32 
 
 
228 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  26.95 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 
238 aa  50.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  28.99 
 
 
233 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  22.75 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  33.02 
 
 
211 aa  49.7  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  27.43 
 
 
229 aa  49.3  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.64 
 
 
234 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  27.43 
 
 
229 aa  49.3  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  29.29 
 
 
203 aa  49.3  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  29.17 
 
 
225 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  28.15 
 
 
233 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  29.17 
 
 
225 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0133  HAD family hydrolase  35.24 
 
 
231 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  29.17 
 
 
225 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  29.17 
 
 
225 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>