274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1984 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1984  haloacid dehalogenase-like hydrolase  100 
 
 
181 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.911586  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0713  hypothetical protein  85.64 
 
 
248 aa  335  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2949  haloacid dehalogenase-like hydrolase  54.6 
 
 
217 aa  193  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.100254  normal  0.0105539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0712  haloacid dehalogenase-like hydrolase  53.71 
 
 
217 aa  191  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.903699  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2188  HAD family hydrolase  45.25 
 
 
220 aa  168  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.45 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  31.45 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1707  haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.3 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  30.06 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  33.06 
 
 
234 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  30.84 
 
 
225 aa  57.8  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  33.64 
 
 
231 aa  57.8  0.00000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  31.78 
 
 
225 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  38.75 
 
 
232 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  36.25 
 
 
230 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  32.2 
 
 
228 aa  56.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  33.9 
 
 
232 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  31.73 
 
 
225 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  36.05 
 
 
231 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  36.25 
 
 
230 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  29.91 
 
 
231 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.37 
 
 
217 aa  55.1  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.31 
 
 
222 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  30.84 
 
 
225 aa  54.7  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  36.25 
 
 
233 aa  54.7  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  31.19 
 
 
227 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  32.35 
 
 
230 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3580  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.2 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  36.25 
 
 
231 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  30.21 
 
 
242 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
231 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  33.72 
 
 
231 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  30.63 
 
 
225 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  36.25 
 
 
231 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.63 
 
 
230 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2928  HAD family hydrolase  40.91 
 
 
230 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244628  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.36 
 
 
268 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5158  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.59 
 
 
222 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.0266654 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  33.72 
 
 
231 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.65 
 
 
193 aa  52.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.803486  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  33.72 
 
 
230 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  34.88 
 
 
230 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  28.46 
 
 
225 aa  52.4  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  33.72 
 
 
255 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 
243 aa  52.4  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  38.1 
 
 
234 aa  52  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  34.48 
 
 
238 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  26.02 
 
 
241 aa  51.2  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 
228 aa  51.2  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3112  hypothetical protein  32.39 
 
 
142 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.472591  normal  0.561703 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  29.76 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  22.35 
 
 
237 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  29.76 
 
 
239 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  34.48 
 
 
238 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  26.83 
 
 
224 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  35.63 
 
 
240 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  34.58 
 
 
227 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  36.25 
 
 
233 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  26.02 
 
 
224 aa  50.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  28.87 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  28.87 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  31.65 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.65 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  28.87 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.19 
 
 
244 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  32.91 
 
 
249 aa  49.7  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  24.26 
 
 
235 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.3 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  28.87 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1551  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
224 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  31.65 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2549  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.14 
 
 
235 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  26.83 
 
 
224 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  30.86 
 
 
211 aa  49.7  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  31.65 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  37.76 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.91 
 
 
214 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  31.03 
 
 
300 aa  48.9  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  27.52 
 
 
225 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  27.52 
 
 
225 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.22 
 
 
229 aa  48.9  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  35.9 
 
 
225 aa  48.9  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  25.87 
 
 
221 aa  48.5  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  35.9 
 
 
225 aa  48.9  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0945  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.06 
 
 
233 aa  48.9  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  27.52 
 
 
225 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  27.52 
 
 
225 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  27.52 
 
 
225 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.91 
 
 
215 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  37.7 
 
 
233 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  28.87 
 
 
225 aa  48.5  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3521  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.71 
 
 
234 aa  48.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  24 
 
 
231 aa  48.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  32.47 
 
 
234 aa  48.1  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  30.58 
 
 
232 aa  48.1  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1791  putative haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase  32.38 
 
 
218 aa  48.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15870  predicted protein  33.7 
 
 
282 aa  47.8  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.296862  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4503  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
224 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 
238 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  29.36 
 
 
218 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>