More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2549 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2549  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 235 aa  481  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2928  HAD family hydrolase  30.33 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  42.35 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0129  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.21 
 
 		 543 aa  70.1  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  27.4 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  35.83 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.56 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  39.13 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  27.39 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  38.89 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1575  HAD family hydrolase  37.38 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000857077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  36.47 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.71 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.37 
 
 		 229 aa  62  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.23 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  35.29 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  27.74 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.68 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  29.22 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  33 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  32.94 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  26.58 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  27.39 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  30.11 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  31.62 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  35.42 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  29.29 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  27.45 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0713  hypothetical protein  24.09 
 
 		 248 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  28.42 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  23.85 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  29.88 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  29.44 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.58 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1170  HAD family hydrolase  36.63 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.382676  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.8 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  31.2 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2501  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.43 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  25.58 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  35.29 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.73 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  33.64 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.17 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  30.18 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  25.12 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  34.38 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  30.17 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.34 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  41.46 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.49 
 
 		 244 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  29.88 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.67 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.32 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.12 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  34.85 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  31.76 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.89 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5409  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.87 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  30.18 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  31.2 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5292  HAD family hydrolase  29.24 
 
 		 231 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  31.76 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0185  flavin mononucleotide phosphatase  29.27 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  44.64 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1511  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  29.03 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.35 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  32.94 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  27.68 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2691  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.5 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3482  HAD family hydrolase  32.69 
 
 		 240 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.894604  normal  0.0749599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  28.14 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5301  HAD family hydrolase  33.65 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  29.6 
 
 		 232 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  32.5 
 
 		 234 aa  52  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  30.11 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  33.71 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.89 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  31.71 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  30.18 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.34 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  30.71 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  26.26 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1251  HAD family phosphatase  32.71 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000890892  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.91 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  27.59 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  35.29 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.98 
 
 		 227 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00306  hydrolase  28.83 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1984  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.14 
 
 		 181 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.911586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.69 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  30.33 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>