159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0129 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0129  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
543 aa  1091    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  39.48 
 
 
583 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5571  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  42.97 
 
 
254 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4905  hydrolase  34.94 
 
 
257 aa  123  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0755  HAD family hydrolase  34.27 
 
 
257 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2549  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.21 
 
 
235 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.26 
 
 
234 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.56 
 
 
217 aa  62.8  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  29.1 
 
 
211 aa  60.8  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3360  HAD family hydrolase  33.02 
 
 
251 aa  60.5  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000863998  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  32.8 
 
 
258 aa  60.1  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.9 
 
 
240 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.43 
 
 
254 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  25.79 
 
 
255 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  31.86 
 
 
242 aa  57.4  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.04 
 
 
259 aa  56.6  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3521  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.63 
 
 
234 aa  56.6  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3196  HAD family hydrolase  37.04 
 
 
237 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.54 
 
 
224 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  33.8 
 
 
208 aa  55.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.65 
 
 
251 aa  55.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  24.32 
 
 
248 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0154  HAD family hydrolase  29.13 
 
 
225 aa  55.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.8 
 
 
248 aa  55.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  25.54 
 
 
224 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2691  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.5 
 
 
212 aa  54.7  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  28.21 
 
 
215 aa  54.7  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  28.21 
 
 
215 aa  54.7  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  30.89 
 
 
224 aa  54.3  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3103  HAD family hydrolase  24.59 
 
 
562 aa  54.3  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  29.03 
 
 
224 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  31.87 
 
 
236 aa  53.9  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  28.69 
 
 
224 aa  53.5  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.58 
 
 
231 aa  53.5  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  33.67 
 
 
226 aa  53.5  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  27.32 
 
 
230 aa  53.5  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  26.96 
 
 
224 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  26.44 
 
 
235 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  28.69 
 
 
223 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  22.4 
 
 
225 aa  52.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  28.69 
 
 
223 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.38 
 
 
248 aa  52  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000545934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  29.89 
 
 
245 aa  51.6  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  25.45 
 
 
233 aa  51.6  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.89 
 
 
221 aa  51.6  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  31.2 
 
 
243 aa  51.2  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1167  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.69 
 
 
236 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2746  HAD family hydrolase  28.97 
 
 
226 aa  50.8  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.20923  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  28.87 
 
 
241 aa  50.8  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.09 
 
 
234 aa  50.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  27.37 
 
 
221 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  20.51 
 
 
230 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  20 
 
 
231 aa  50.1  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  32.84 
 
 
238 aa  50.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  32.84 
 
 
227 aa  50.1  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  19.32 
 
 
225 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  19.27 
 
 
231 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  23.19 
 
 
231 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  20 
 
 
230 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.74 
 
 
232 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  32.09 
 
 
221 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.68 
 
 
227 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2051  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.91 
 
 
230 aa  48.9  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0164056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1653  HAD family hydrolase  34.91 
 
 
230 aa  49.3  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  0.146413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.58 
 
 
244 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  27.45 
 
 
253 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
221 aa  49.7  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3292  HAD family hydrolase  39.76 
 
 
214 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125933 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  28.21 
 
 
242 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  18.75 
 
 
230 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  20 
 
 
231 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  23.57 
 
 
217 aa  48.9  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  31.25 
 
 
207 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  23.93 
 
 
234 aa  48.1  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  32.39 
 
 
233 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  32.39 
 
 
233 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  30.21 
 
 
128 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  30.3 
 
 
255 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.93 
 
 
268 aa  47.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2329  HAD-superfamily hydrolase  46.15 
 
 
217 aa  47.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.480139 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.96 
 
 
197 aa  47.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.48 
 
 
230 aa  47.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  33.01 
 
 
231 aa  47.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1146  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.87 
 
 
210 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  29.73 
 
 
239 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  29.73 
 
 
239 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  26.01 
 
 
227 aa  47.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  28.07 
 
 
232 aa  47  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  26.6 
 
 
225 aa  47  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.48 
 
 
222 aa  47.4  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0159  hydrolase  26.19 
 
 
259 aa  47.4  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.971572  normal  0.683122 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  27.54 
 
 
218 aa  47  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  29.3 
 
 
219 aa  46.6  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  26.32 
 
 
263 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0133  HAD family hydrolase  32.2 
 
 
231 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0804  nucleotidase  31.58 
 
 
201 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 
238 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  29.7 
 
 
209 aa  47  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.82 
 
 
230 aa  47  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.2 
 
 
216 aa  46.6  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>