175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4905 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4905  hydrolase  100 
 
 
257 aa  503  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0755  HAD family hydrolase  66 
 
 
257 aa  306  3e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5571  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  38.55 
 
 
254 aa  158  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0129  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.37 
 
 
543 aa  129  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.17 
 
 
583 aa  115  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  36 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.75 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  35.14 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  31.14 
 
 
208 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.14 
 
 
248 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  27.53 
 
 
255 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1460  HAD family hydrolase  35.62 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00552213  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.05 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.61 
 
 
232 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  36.52 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.21 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2549  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.68 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.95 
 
 
200 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  27.52 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  27.52 
 
 
233 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  37.96 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  30.61 
 
 
234 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  36.73 
 
 
240 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.12 
 
 
227 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1992  hydrolase  33.33 
 
 
254 aa  49.7  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.360933  decreased coverage  0.00169391 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.19 
 
 
234 aa  49.3  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.24 
 
 
235 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  29.32 
 
 
226 aa  49.3  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2052  HAD superfamily hydrolase  29.17 
 
 
707 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380026  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.64 
 
 
227 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3689  HAD family hydrolase  29.17 
 
 
707 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3360  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
251 aa  48.9  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000863998  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03688  predicted hydrolase  34.91 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.732236  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4167  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.91 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4272  flavin mononucleotide phosphatase  34.91 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4178  flavin mononucleotide phosphatase  34.91 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.044421 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4195  flavin mononucleotide phosphatase  34.91 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0542351  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5251  flavin mononucleotide phosphatase  34.91 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03637  hypothetical protein  34.91 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.941036  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4037  flavin mononucleotide phosphatase  34.91 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4331  flavin mononucleotide phosphatase  34.91 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  29.7 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4337  flavin mononucleotide phosphatase  34.59 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  35.58 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4278  flavin mononucleotide phosphatase  34.59 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  37.1 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.36 
 
 
219 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2188  HAD family hydrolase  27.92 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4230  flavin mononucleotide phosphatase  34.59 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  28.24 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4178  flavin mononucleotide phosphatase  34.59 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.143469  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  28.71 
 
 
234 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4160  flavin mononucleotide phosphatase  34.62 
 
 
238 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  30.89 
 
 
231 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  29.46 
 
 
221 aa  47  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  35.51 
 
 
133 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  36.92 
 
 
245 aa  47  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  35.83 
 
 
217 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  32.74 
 
 
213 aa  46.6  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1153  HAD family hydrolase  30.39 
 
 
252 aa  46.6  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.94325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1571  HAD family hydrolase  26.47 
 
 
714 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.882263 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
217 aa  46.2  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  29.52 
 
 
235 aa  46.2  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0352  HAD family hydrolase  31.3 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.584229  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  25.19 
 
 
248 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.99 
 
 
268 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.33 
 
 
259 aa  45.8  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  21.55 
 
 
231 aa  46.2  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  32.09 
 
 
271 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0096  HAD family hydrolase  35.46 
 
 
238 aa  45.4  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.803846  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3103  HAD family hydrolase  32.06 
 
 
562 aa  45.4  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4110  HAD superfamily hydrolase  31.47 
 
 
244 aa  45.4  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  29.33 
 
 
214 aa  45.4  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
225 aa  45.4  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.91 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0708331 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.59 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  39.34 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  36.96 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  32.29 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.4 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296794  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  27.87 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.99 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 
219 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  29.77 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  32.11 
 
 
242 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0145  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  26.95 
 
 
204 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.7 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.19 
 
 
217 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  28.33 
 
 
235 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  33.81 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  32.31 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1688  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.76 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  32.31 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  39.8 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0863  HAD-superfamily hydrolase  39.53 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00905337  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0472  HAD family hydrolase  28.91 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.523945  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 
221 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.46 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>