More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1535 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  100 
 
 
213 aa  432  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  44.23 
 
 
221 aa  187  9e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  43.93 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  48.53 
 
 
241 aa  181  7e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  46.34 
 
 
235 aa  174  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0708331 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0472  HAD family hydrolase  41.43 
 
 
261 aa  171  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.523945  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  40.98 
 
 
228 aa  139  3e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  34.42 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  34.95 
 
 
211 aa  101  8e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  28.11 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  27.31 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  28.93 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  27.31 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  28.67 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  32.85 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  37.14 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  33.14 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  32.81 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  28.12 
 
 
224 aa  72  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  37.1 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  27.22 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  31.07 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  32.03 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.28 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0497866  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  35.04 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  34.23 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  30.33 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  35.48 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.49 
 
 
268 aa  68.2  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  27.27 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  31.49 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  35.43 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  34.18 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  30.72 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  26.04 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  35.2 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.9 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  35 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  30.72 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  27.12 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  30.86 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  33.13 
 
 
216 aa  65.5  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  30.88 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.74 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  34.53 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  35.48 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  26.25 
 
 
272 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.22 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  28.87 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  28.87 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  28.87 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  36.89 
 
 
230 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  28.87 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  36.89 
 
 
232 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  29.84 
 
 
226 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  32.56 
 
 
238 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.93 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  32.58 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  28.87 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  35.24 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
250 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  32.77 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  38.06 
 
 
243 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.68 
 
 
231 aa  63.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  25.36 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
231 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.69 
 
 
238 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  30.82 
 
 
222 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.51 
 
 
250 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  37.14 
 
 
216 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  35.25 
 
 
226 aa  63.2  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
237 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  28.35 
 
 
272 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  26.75 
 
 
272 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  37.62 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.24 
 
 
222 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  27.59 
 
 
229 aa  62.4  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  37.14 
 
 
216 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  34.13 
 
 
229 aa  62.8  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  34.4 
 
 
242 aa  62.4  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.25 
 
 
222 aa  62.4  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  26.09 
 
 
272 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  33.59 
 
 
225 aa  62  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  37.14 
 
 
216 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  31.89 
 
 
264 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  31.71 
 
 
227 aa  62  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  31.15 
 
 
231 aa  62  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.53 
 
 
218 aa  62  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  31.55 
 
 
223 aa  61.6  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  28.67 
 
 
228 aa  61.6  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  29.32 
 
 
223 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.56 
 
 
234 aa  61.6  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  37.25 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.03 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.85 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08650  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.29 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  33.09 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  29.11 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  28.35 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>