163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0755 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0755  HAD family hydrolase  100 
 
 		 257 aa  513  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4905  hydrolase  66.27 
 
 		 257 aa  316  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5571  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  41.11 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0129  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.13 
 
 		 543 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.34 
 
 		 583 aa  118  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.39 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.97 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  28.43 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.73 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  31.54 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.58 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  29.52 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  27.05 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2674  histidinol-phosphate phosphatase family protein  34.09 
 
 		 195 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3360  HAD family hydrolase  31.43 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000863998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  25.22 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  25.17 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  40.82 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.29 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  38.1 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  38.1 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  38.1 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  38.1 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  38.1 
 
 		 242 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  38.1 
 
 		 245 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  38.1 
 
 		 245 aa  52.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  29.8 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3567  HAD family hydrolase  38 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.45 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  34.15 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1460  HAD family hydrolase  32.41 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00552213  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.42 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  34.15 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  34.15 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  34.15 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  34.15 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  28.87 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.26 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1218  putative hydrolase  37.78 
 
 		 762 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  23.36 
 
 		 207 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.81 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 		 228 aa  49.3  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  29.37 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3292  HAD family hydrolase  37.08 
 
 		 214 aa  49.3  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125933 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4077  HAD family hydrolase  25.69 
 
 		 238 aa  48.9  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1992  hydrolase  31.01 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.360933  decreased coverage  0.00169391 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  32.23 
 
 		 234 aa  48.9  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  30.93 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  30.96 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  27.35 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  28.12 
 
 		 217 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2549  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.45 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  27.35 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0854656 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2691  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.84 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  36.19 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  28.45 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22171  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  29.79 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2698  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  38.1 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182106  normal  0.0745775 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  33.07 
 
 		 227 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  25.76 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.7 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  36.84 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.43 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.65 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1819  HAD family hydrolase  36.05 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2430  HAD family hydrolase  36.05 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3065  HAD family hydrolase  36.26 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.123759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2052  HAD superfamily hydrolase  26.62 
 
 		 707 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.59 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.25 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0352  HAD family hydrolase  30.28 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.584229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3689  HAD family hydrolase  26.62 
 
 		 707 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  31.4 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  30.7 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  32.52 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  31.93 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1571  HAD family hydrolase  26.47 
 
 		 714 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882263 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1773  hydrolase  30.36 
 
 		 251 aa  45.8  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.672363 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1504  HAD family hydrolase  34.02 
 
 		 249 aa  45.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000137172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5761  HAD family hydrolase  34.88 
 
 		 230 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2390  hypothetical protein  24.42 
 
 		 239 aa  45.8  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6884  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.97 
 
 		 207 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  35.23 
 
 		 242 aa  45.4  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.35 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  34.38 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.15 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7621  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.7 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  30.82 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02490  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  29.67 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0226409 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3953  HAD family hydrolase  35.05 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261724 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.74 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1824  HAD family hydrolase  38.37 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  34.26 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11260  histidinol-phosphate phosphatase family protein  35.59 
 
 		 499 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130521  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  33.7 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3413  epoxide hydrolase-like phosphatase  25.87 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15685  normal  0.959449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2787  phosphoglycolate phosphatase  37.65 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>