More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_02490 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_02490  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  100 
 
 
224 aa  456  1e-127  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0226409 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.35 
 
 
222 aa  159  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01320  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  34.55 
 
 
219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  30.53 
 
 
454 aa  93.6  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.83 
 
 
218 aa  90.5  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00251058  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.05 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  26.85 
 
 
217 aa  77  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  26.39 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.89 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0670  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.27 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0792  beta-phosphoglucomutase  25 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.22 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.47 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.17 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4073  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  29.57 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.358464  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.7 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.77 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.74 
 
 
219 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184484  hitchhiker  0.000000000456944 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.08 
 
 
233 aa  62  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.74 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000024214  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.95 
 
 
238 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27350  HAD-superfamily hydrolase  29.86 
 
 
229 aa  59.3  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.88 
 
 
220 aa  59.3  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000345367  normal  0.0902559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  28.18 
 
 
214 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3926  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.59 
 
 
219 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238408  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3593  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.23 
 
 
218 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3906  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.59 
 
 
219 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000443869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.86 
 
 
229 aa  58.2  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.19 
 
 
222 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.58 
 
 
221 aa  58.5  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1853  HAD family hydrolase  26.88 
 
 
235 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147437  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.32 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  28.97 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1717  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.35 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  26.02 
 
 
456 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25280  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  26.56 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0213796  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.23 
 
 
218 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  27.64 
 
 
221 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2022  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.35 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.35 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.905236  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.35 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0029739  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1451  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.35 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.913842  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20940  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.07 
 
 
273 aa  56.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  28.7 
 
 
224 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  28.7 
 
 
224 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  24.86 
 
 
223 aa  55.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  28.7 
 
 
224 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  28.7 
 
 
224 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  28.7 
 
 
224 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  28.7 
 
 
224 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  25.12 
 
 
220 aa  55.1  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0682  HAD hydrolase, family IA, variant 3  25.95 
 
 
226 aa  55.1  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.95 
 
 
213 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  29.79 
 
 
219 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13910  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  26.37 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.491881  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  26.32 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1419  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.88 
 
 
222 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  hitchhiker  0.00259415 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01696  predicted hydrolase  25.35 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.35 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.752357  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  25.67 
 
 
456 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1905  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.35 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.798501  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0020  6-phosphogluconate phosphatase  25.43 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  27.04 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01684  hypothetical protein  25.35 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  25.35 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.305682  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  26.34 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4047  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.59 
 
 
219 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000965281  normal  0.234971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1798  phosphatase/phosphohexomutase-like protein  31.37 
 
 
255 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00404903  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11830  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  31.12 
 
 
246 aa  52.8  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0867005  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1218  putative hydrolase  29.84 
 
 
762 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25290  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.32 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0218735  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2448  putative phosphatase  26.61 
 
 
216 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.745831  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3432  putative phosphatase  26.61 
 
 
216 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.166368  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4252  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.39 
 
 
221 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1947  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.88 
 
 
222 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1972  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.88 
 
 
222 aa  52.8  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  23.15 
 
 
223 aa  52.4  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2445  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.88 
 
 
222 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1464  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.88 
 
 
222 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02218  predicted hydrolase or phosphatase  26.61 
 
 
216 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  25.86 
 
 
252 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  25.86 
 
 
252 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1363  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.61 
 
 
216 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0110117  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  21.03 
 
 
216 aa  52.4  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1359  putative phosphatase  26.61 
 
 
216 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.348521 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  25.86 
 
 
252 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2442  putative phosphatase  26.61 
 
 
216 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647489  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2586  putative phosphatase  26.61 
 
 
216 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118565  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02178  hypothetical protein  26.61 
 
 
216 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  25.91 
 
 
223 aa  52  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2669  putative phosphatase  27.27 
 
 
216 aa  52  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.91748  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.65 
 
 
225 aa  52  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  23.32 
 
 
214 aa  51.6  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1676  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.52 
 
 
236 aa  51.6  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.419721  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3972  HAD family hydrolase  27.53 
 
 
241 aa  51.6  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.09 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2746  HAD family hydrolase  28.72 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.906764  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3605  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.97 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0167  HAD family hydrolase  25.23 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2790  HAD family hydrolase  28.72 
 
 
240 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>