208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3360 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3360  HAD family hydrolase  100 
 
 
251 aa  521  1e-147  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000863998  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1878  HAD superfamily hydrolase  37.5 
 
 
261 aa  165  8e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0128231  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  28.51 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  28.51 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  29.78 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  29.03 
 
 
248 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  34.45 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  26.51 
 
 
234 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  27.84 
 
 
235 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0129  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.02 
 
 
543 aa  60.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  31.71 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.11 
 
 
254 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  30.95 
 
 
231 aa  59.3  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  32.26 
 
 
231 aa  58.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  32.32 
 
 
217 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  31.45 
 
 
231 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  30 
 
 
245 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  31.45 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  32.77 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  32.12 
 
 
234 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  31.4 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  32.41 
 
 
234 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1167  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.15 
 
 
236 aa  55.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.83 
 
 
230 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  33.33 
 
 
245 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.27 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  34.21 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  28.97 
 
 
300 aa  54.3  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  24.77 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  40 
 
 
233 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  25.97 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  40.62 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.23 
 
 
234 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  34.07 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  37.5 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  38 
 
 
230 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0673  HAD family hydrolase  23.48 
 
 
211 aa  53.1  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.38 
 
 
583 aa  53.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  32 
 
 
233 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  31.82 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  26.99 
 
 
229 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  37.08 
 
 
215 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.84 
 
 
237 aa  52.4  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.845236  normal  0.047743 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  28.07 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  29.22 
 
 
225 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  26.49 
 
 
241 aa  52.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  38 
 
 
230 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0422  HAD family hydrolase  25.98 
 
 
217 aa  52.4  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2637  hypothetical protein  27.91 
 
 
813 aa  52  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.38 
 
 
230 aa  52  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.93 
 
 
251 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1937  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.04 
 
 
231 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.612743  normal  0.0123866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.8 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  27.49 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.49 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00490  hydrolase  27.27 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  26.98 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0332  HAD family hydrolase  34.29 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1856  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.66 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  27.49 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  31.01 
 
 
233 aa  50.8  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  26.76 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  34.78 
 
 
234 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  27.49 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.35 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  26.47 
 
 
224 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  29.17 
 
 
235 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  34.07 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1655  HAD family phosphatase  27.73 
 
 
175 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1690  HAD family phosphatase  27.73 
 
 
175 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0133  HAD family hydrolase  31.91 
 
 
231 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0085  HAD family hydrolase  27.05 
 
 
241 aa  49.7  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.658322  hitchhiker  0.00000571122 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  25.49 
 
 
224 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  27.45 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25.49 
 
 
224 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  25.49 
 
 
224 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  27.88 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.97 
 
 
235 aa  49.7  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  28.12 
 
 
242 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.85 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  30 
 
 
228 aa  49.3  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.43 
 
 
259 aa  49.3  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5571  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  23.53 
 
 
254 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  25.49 
 
 
223 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.01 
 
 
231 aa  48.9  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1165  HAD superfamily hydrolase  26.05 
 
 
175 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.504766  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1762  HAD superfamily hydrolase  29.46 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0794121  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  25.89 
 
 
217 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  28.04 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  29.91 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  29.91 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  29.91 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1687  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.13 
 
 
248 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0106556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  24.49 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  28.12 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  28.12 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.32 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  27.49 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  37.08 
 
 
232 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4187  HAD family phosphatase  32 
 
 
170 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>