More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0872 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
230 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35120  haloacid dehalogenase superfamily protein  54.09 
 
 
228 aa  237  9e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.860746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0023  HAD family hydrolase  50.66 
 
 
228 aa  215  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0949  HAD family hydrolase  50.43 
 
 
235 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60922  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0737  HAD family hydrolase  49.78 
 
 
230 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421268  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0751  HAD family hydrolase  49.78 
 
 
230 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.170461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0731  HAD family hydrolase  49.78 
 
 
230 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1688  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  48.02 
 
 
230 aa  191  7e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.520793  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0361  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  42.99 
 
 
203 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.751245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2475  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.34 
 
 
232 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2255  HAD family hydrolase  42.55 
 
 
228 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  0.797248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2373  HAD family hydrolase  42.02 
 
 
253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3166  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  38.41 
 
 
209 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0542047  hitchhiker  0.0000136162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1991  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.12 
 
 
219 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  34.88 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  24.88 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.38 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  35.71 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.43 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  24.63 
 
 
234 aa  62.8  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  24.5 
 
 
234 aa  62.4  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  33.67 
 
 
218 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  29.47 
 
 
292 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  28.99 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.35 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  27.93 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  29.91 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  31.09 
 
 
217 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  41.76 
 
 
236 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  27.47 
 
 
228 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  35 
 
 
220 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  29.13 
 
 
233 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  29.13 
 
 
233 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  27 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  33.61 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  37.96 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.43 
 
 
251 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.31 
 
 
237 aa  55.1  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  29.77 
 
 
222 aa  55.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.2 
 
 
227 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1762  HAD superfamily hydrolase  32.35 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0794121  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  30.61 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  32.56 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  39.53 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.58 
 
 
227 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.71 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  30.3 
 
 
207 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.95 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  36.05 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.28 
 
 
244 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  34.41 
 
 
230 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.5 
 
 
237 aa  52.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.845236  normal  0.047743 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  32.46 
 
 
218 aa  52.4  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  26.61 
 
 
252 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.95 
 
 
241 aa  51.6  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  27.86 
 
 
228 aa  52  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.68 
 
 
250 aa  51.2  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  31.13 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0796  HAD family hydrolase  34.12 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3178  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.64 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00001464  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  31.01 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.59 
 
 
217 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  26.85 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  34.88 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0642  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.04 
 
 
206 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0688411  normal  0.579758 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  30.84 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  26.85 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.29 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.82 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  26.61 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  30.84 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2928  HAD family hydrolase  26.47 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244628  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0576  phosphoglycolate phosphatase  28.8 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475969  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  26.61 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  26.85 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  36.26 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  32.26 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  36.25 
 
 
978 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  30.24 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.33 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  34.88 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  33.33 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  30.24 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  32.46 
 
 
226 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  32.41 
 
 
133 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2026  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
203 aa  49.7  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.151114  normal  0.583157 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  31.58 
 
 
240 aa  49.3  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2832  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.63 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  32.26 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  32.99 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  32.26 
 
 
230 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  41.56 
 
 
243 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
252 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13412  hypothetical protein  33.88 
 
 
217 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  28.82 
 
 
227 aa  49.3  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  23.68 
 
 
223 aa  48.9  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  26.85 
 
 
252 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  26.85 
 
 
252 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1570  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.42 
 
 
223 aa  48.9  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.748306  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2947  HAD superfamily hydrolase  25.6 
 
 
247 aa  48.9  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>