140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2947 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2947  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
247 aa  510  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0754  hydrolase  35.93 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00261595  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2046  hypothetical protein  35.17 
 
 
235 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2094  hydrolase  34.35 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0172  hydrolase  35.51 
 
 
243 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0542  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.34 
 
 
242 aa  126  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.657376 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1690  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.29 
 
 
237 aa  123  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2074  hydrolase  33.64 
 
 
235 aa  116  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0658329  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3082  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.6 
 
 
231 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.378821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18050  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.13 
 
 
208 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0996  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
200 aa  91.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.196077  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1134  HAD family hydrolase  33.16 
 
 
200 aa  90.9  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0982  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.37 
 
 
269 aa  88.6  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07140  predicted phosphatase  26.97 
 
 
239 aa  84.7  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.580043 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0624  hydrolase  32.23 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12620  predicted phosphatase  27.1 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  26.37 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.36 
 
 
225 aa  58.9  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  29.35 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5294  HAD family hydrolase  27.6 
 
 
224 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.08015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4472  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.8 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  26.77 
 
 
223 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  28.86 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1762  HAD superfamily hydrolase  29.41 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0794121  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2336  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.509915  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  24.06 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1687  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.22 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0106556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2426  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.6 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  24.06 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6309  HAD family hydrolase  25.11 
 
 
224 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.403057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1317  HAD family hydrolase  25.11 
 
 
224 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.716581  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6512  HAD family hydrolase  25.11 
 
 
224 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4360  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.54 
 
 
223 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2149  HAD family hydrolase  27.6 
 
 
224 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376936  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  25.51 
 
 
223 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6102  HAD family hydrolase  25.11 
 
 
224 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.524869  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4249  HAD family hydrolase  24.87 
 
 
224 aa  52  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  28.29 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7037  HAD family hydrolase  25.4 
 
 
224 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.927677 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0100  HAD family hydrolase  26.05 
 
 
468 aa  51.2  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0368988  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5583  HAD family hydrolase  25.11 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4275  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  26.56 
 
 
224 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0625662 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  26.04 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2109  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.6 
 
 
224 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.546495 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0822  HAD family hydrolase  25.65 
 
 
224 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.923988 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  21.7 
 
 
231 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  21.7 
 
 
231 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  21.7 
 
 
230 aa  50.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  26.91 
 
 
226 aa  50.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  29 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.79 
 
 
218 aa  50.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  22.92 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  25 
 
 
224 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0513  HAD family hydrolase  26.16 
 
 
225 aa  49.7  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5624  HAD family hydrolase  24.23 
 
 
228 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147818  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.77 
 
 
217 aa  48.9  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.6 
 
 
230 aa  48.9  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  25.52 
 
 
223 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  22.88 
 
 
230 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  22.4 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  22.4 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  22.4 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  22.4 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  22.4 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  22.4 
 
 
216 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  26.53 
 
 
262 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  22.77 
 
 
221 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.98 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  24.48 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4411  HAD family hydrolase  23.16 
 
 
224 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.981308  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  22.12 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  25.38 
 
 
221 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0521  hypothetical protein  25.49 
 
 
228 aa  48.1  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0287  HAD superfamily hydrolase  24.29 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727823  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.35 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0302  HAD superfamily hydrolase  24.29 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.795024  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2484  HAD family hydrolase  26.18 
 
 
233 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4503  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.13 
 
 
224 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  20.9 
 
 
215 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  23.58 
 
 
216 aa  47  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  21.88 
 
 
212 aa  47  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  23.83 
 
 
224 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  23.58 
 
 
216 aa  46.2  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0520  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.18 
 
 
217 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  23.96 
 
 
224 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0033  HAD family hydrolase  26.87 
 
 
228 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  21.99 
 
 
216 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  23.83 
 
 
224 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.12 
 
 
222 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  27.14 
 
 
212 aa  45.8  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  22.41 
 
 
222 aa  45.8  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  28.96 
 
 
218 aa  45.4  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  24.48 
 
 
234 aa  45.4  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1912  2-deoxyglucose-6-phosphatase  26.72 
 
 
223 aa  45.4  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3129  HAD family hydrolase  26.47 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  27.39 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.19 
 
 
230 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  24.02 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  22.03 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  23.68 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>