58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1134 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1134  HAD family hydrolase  100 
 
 
200 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0996  HAD family hydrolase  99 
 
 
200 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.196077  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0624  hydrolase  43.14 
 
 
208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2074  hydrolase  36.32 
 
 
235 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0658329  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2094  hydrolase  39.3 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0542  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.86 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.657376 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2046  hypothetical protein  36.18 
 
 
235 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0754  hydrolase  35.1 
 
 
240 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00261595  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1690  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.64 
 
 
237 aa  98.6  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07140  predicted phosphatase  32.16 
 
 
239 aa  95.9  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.580043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3082  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.43 
 
 
231 aa  94.7  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.378821  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0172  hydrolase  32.61 
 
 
243 aa  92.8  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2947  HAD superfamily hydrolase  33.16 
 
 
247 aa  90.9  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18050  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  46.81 
 
 
208 aa  88.2  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0982  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.95 
 
 
269 aa  82  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12620  predicted phosphatase  29.06 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  24.87 
 
 
228 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.5 
 
 
218 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.37 
 
 
219 aa  49.3  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  26.26 
 
 
221 aa  48.5  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2067  HAD family hydrolase  25.37 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000117425  hitchhiker  0.0000127527 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1980  HAD family hydrolase  25.37 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561924  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  34.45 
 
 
225 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.7 
 
 
248 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121216 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  23.35 
 
 
228 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  25.12 
 
 
241 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.85 
 
 
218 aa  46.2  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  28.81 
 
 
232 aa  45.4  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1994  HAD family hydrolase  24.5 
 
 
202 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000168215  unclonable  0.0000194697 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  24.02 
 
 
207 aa  45.1  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  21.5 
 
 
202 aa  45.1  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.73 
 
 
219 aa  45.1  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  27.78 
 
 
230 aa  44.7  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  23.59 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  24.49 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  35.29 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 
243 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  30 
 
 
214 aa  43.5  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4647  HAD family phosphatase  36.84 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  22.38 
 
 
225 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  24.38 
 
 
219 aa  43.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3313  putative phosphatase  25.84 
 
 
218 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109043  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  27.45 
 
 
226 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  24.12 
 
 
216 aa  42.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  26.09 
 
 
242 aa  42.7  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  23.98 
 
 
201 aa  42.4  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1687  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.55 
 
 
248 aa  42.4  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0106556 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2188  HAD family hydrolase  27.78 
 
 
220 aa  42.4  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  24.12 
 
 
256 aa  42  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  28.93 
 
 
227 aa  42  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1715  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.68 
 
 
218 aa  42  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  21.83 
 
 
246 aa  41.6  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 
268 aa  42  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  19.8 
 
 
231 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  22.45 
 
 
215 aa  41.6  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  21.39 
 
 
227 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2121  epoxide hydrolase domain-containing phosphatase  43.18 
 
 
215 aa  41.2  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>