175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2046 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2046  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  486  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0754  hydrolase  38.98 
 
 		 240 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00261595  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1690  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  42.8 
 
 		 237 aa  178  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0172  hydrolase  40.64 
 
 		 243 aa  178  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2094  hydrolase  40.77 
 
 		 283 aa  174  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0542  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.79 
 
 		 242 aa  171  7.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.657376 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2947  HAD superfamily hydrolase  35.17 
 
 		 247 aa  151  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18050  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.19 
 
 		 208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3082  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.21 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.378821  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2074  hydrolase  32.23 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0658329  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07140  predicted phosphatase  32.2 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.580043 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0996  HAD family hydrolase  36.18 
 
 		 200 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.196077  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1134  HAD family hydrolase  36.18 
 
 		 200 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0982  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.78 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12620  predicted phosphatase  30.71 
 
 		 298 aa  97.8  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0624  hydrolase  25.98 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  32.7 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  32.23 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  25.37 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  28.29 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  28.15 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  28.15 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1912  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.41 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.51 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  30.33 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0437  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.79 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000756317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  23.44 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  23.65 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.27 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  25.46 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  25 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0732  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.91 
 
 		 252 aa  52  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.595583  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  28.31 
 
 		 222 aa  52.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.61 
 
 		 221 aa  52  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  25 
 
 		 224 aa  52  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  25 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  27.1 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  23.63 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3166  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  30.43 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0542047  hitchhiker  0.0000136162 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  23.67 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  24.54 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2185  phosphoglycolate phosphatase  27.69 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279465  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  27.01 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  25 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  23.47 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  25.77 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  25.12 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  25.26 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  27.96 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  25.36 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  27.16 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.05 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  22.17 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  23.41 
 
 		 216 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  23.21 
 
 		 215 aa  48.5  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  23.79 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.94 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  23.88 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  23.44 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01696  predicted hydrolase  24.64 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.64 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.752357  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  23.08 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2739  phosphoglycolate phosphatase  27.04 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  23.9 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1905  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.64 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.798501  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.04 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1464  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.64 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2445  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.64 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3116  phosphoglycolate phosphatase  27.05 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0121451 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1972  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.64 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01684  hypothetical protein  24.64 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  26.13 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.041002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.64 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.305682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1947  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.64 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  22.93 
 
 		 216 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  24.37 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3473  HAD family hydrolase  24.41 
 
 		 243 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  27.45 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  27.45 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  26.69 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  22.27 
 
 		 216 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  25.76 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  22.93 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  22.93 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  23.74 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  26.85 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.77 
 
 		 218 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  29.33 
 
 		 221 aa  46.2  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  24.51 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  22.93 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  22.93 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  22.66 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  23.15 
 
 		 231 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  28.29 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  23.38 
 
 		 221 aa  45.4  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  24.15 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.905236  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>