34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0624 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0624  hydrolase  100 
 
 		 208 aa  417  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0996  HAD family hydrolase  43.14 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.196077  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1134  HAD family hydrolase  43.14 
 
 		 200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3082  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.77 
 
 		 231 aa  101  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.378821  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1690  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.41 
 
 		 237 aa  92.8  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2094  hydrolase  29.23 
 
 		 283 aa  90.1  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2074  hydrolase  29 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0658329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0542  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.64 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.657376 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0172  hydrolase  32.76 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0982  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.72 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0754  hydrolase  25.76 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00261595  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18050  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.3 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2947  HAD superfamily hydrolase  32.23 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2046  hypothetical protein  25.98 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07140  predicted phosphatase  27.32 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.580043 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12620  predicted phosphatase  28.86 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  46.81 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  32.89 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  33.72 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  36.21 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  32.89 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  36.21 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2038  HAD superfamily hydrolase  25.42 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.47 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1444  HAD superfamily hydrolase  34.69 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000160322  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2336  HAD family hydrolase  31.58 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.509915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0361  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  40.48 
 
 		 203 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.751245  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.86 
 
 		 233 aa  42.4  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2291  HAD family hydrolase  31.51 
 
 		 218 aa  41.6  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.81 
 
 		 268 aa  41.6  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1355  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.25 
 
 		 228 aa  41.6  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0712  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.17 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.903699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  45.16 
 
 		 222 aa  41.2  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>