46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2074 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2074  hydrolase  100 
 
 
235 aa  482  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0658329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0542  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.6 
 
 
242 aa  175  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.657376 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2094  hydrolase  40.61 
 
 
283 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07140  predicted phosphatase  39.83 
 
 
239 aa  164  6.9999999999999995e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.580043 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12620  predicted phosphatase  36.24 
 
 
298 aa  154  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0982  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.5 
 
 
269 aa  151  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0754  hydrolase  38.77 
 
 
240 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00261595  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18050  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  44.69 
 
 
208 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1690  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.46 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0172  hydrolase  32.56 
 
 
243 aa  122  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2046  hypothetical protein  32.23 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2947  HAD superfamily hydrolase  33.64 
 
 
247 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0996  HAD family hydrolase  37.06 
 
 
200 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.196077  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1134  HAD family hydrolase  36.32 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3082  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.39 
 
 
231 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.378821  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0624  hydrolase  29 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  27.55 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  26.76 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  26.29 
 
 
216 aa  55.1  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  26.29 
 
 
216 aa  55.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  26.29 
 
 
216 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  26.29 
 
 
216 aa  55.1  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  26.29 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  25.5 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  27.1 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  25.82 
 
 
216 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  27.1 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  25.89 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2463  HAD family hydrolase  27.12 
 
 
209 aa  45.8  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  25.85 
 
 
248 aa  45.1  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4680  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.45 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  24.55 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5658  HAD superfamily hydrolase  24.76 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.76 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  24.88 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  24.76 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  26.29 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5260  HAD superfamily hydrolase  24.76 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3591  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.04 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716122  hitchhiker  0.00156423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  27.49 
 
 
224 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  24.39 
 
 
219 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  26.27 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3184  phosphoglycolate phosphatase  26.58 
 
 
221 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.903227  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  26.27 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  27.73 
 
 
232 aa  42  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>