290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_68390 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_68390  putative hydrolase  100 
 
 		 221 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.024723  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5917  putative hydrolase  97.27 
 
 		 221 aa  430  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0284  HAD family hydrolase  78.64 
 
 		 220 aa  353  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0283  HAD family hydrolase  78.18 
 
 		 220 aa  353  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0274  HAD family hydrolase  78.18 
 
 		 220 aa  352  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4951  HAD family hydrolase  77.73 
 
 		 220 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.157409  hitchhiker  0.0000190685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0259  HAD superfamily hydrolase  77.73 
 
 		 220 aa  349  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05480  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  76.82 
 
 		 221 aa  339  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0392  HAD family hydrolase  76.36 
 
 		 220 aa  336  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339275  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5403  HAD-superfamily hydrolase  71.36 
 
 		 220 aa  329  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4942  HAD family hydrolase  71.36 
 
 		 220 aa  327  8e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2930  putative hydrolase  56.74 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0839  HAD family hydrolase  58.02 
 
 		 219 aa  245  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.18437  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0139  HAD family hydrolase  51.36 
 
 		 227 aa  241  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2982  HAD superfamily hydrolase  54.46 
 
 		 217 aa  230  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0423  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  52.15 
 
 		 230 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1757  HAD family hydrolase  46.73 
 
 		 226 aa  223  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3624  carboxylyase-like protein  51.01 
 
 		 222 aa  217  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.701586 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0151  HAD family hydrolase  50.23 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0397198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0162  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.16 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0167  HAD family hydrolase  51.16 
 
 		 220 aa  215  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0162  HAD family hydrolase  51.16 
 
 		 220 aa  214  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0164  HAD family hydrolase  50.7 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0177  HAD family hydrolase  50.23 
 
 		 220 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3556  HAD family hydrolase  49.77 
 
 		 233 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0160  HAD family hydrolase  50.23 
 
 		 220 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2660  HAD family hydrolase  53.46 
 
 		 224 aa  211  7.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.72425  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3751  HAD family hydrolase  53.54 
 
 		 229 aa  211  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.312965  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0329  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  48.18 
 
 		 225 aa  208  4e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4195  HAD family hydrolase  49.77 
 
 		 220 aa  207  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4614  HAD family hydrolase  45.45 
 
 		 225 aa  206  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0128  HAD family hydrolase  47.93 
 
 		 224 aa  204  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1694  HAD superfamily hydrolase  48.13 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4347  HAD family hydrolase  47.62 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.743736  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03970  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  48.8 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0155  HAD family hydrolase  46.54 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0107208  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0182  HAD family hydrolase  49.31 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3893  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.75 
 
 		 228 aa  201  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.29 
 
 		 238 aa  201  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.849199  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45 
 
 		 234 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0369  HAD family hydrolase  52.04 
 
 		 228 aa  198  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243044 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0222  HAD family hydrolase  47.64 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4719  HAD family hydrolase  48.1 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1570  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.33 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.748306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.23 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000944364  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1630  haloacid dehalogenase-like hydrolase  45.12 
 
 		 228 aa  193  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2986  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  49.73 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28871e-26 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0116  HAD family hydrolase  46.01 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1394  HAD family hydrolase  45.28 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1723  HAD family hydrolase  44.95 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1891  hydrolase  45.02 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000708914  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2217  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  44.86 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3812  HAD family hydrolase  43.78 
 
 		 227 aa  188  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3736  HAD family hydrolase  42.47 
 
 		 226 aa  188  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3975  HAD family hydrolase  42.47 
 
 		 226 aa  188  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0177  HAD family hydrolase  42.47 
 
 		 226 aa  188  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03251  predicted hydrolase  42.66 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3595  HAD family hydrolase  42.66 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0314  HAD family hydrolase  42.66 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.104507 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03203  hypothetical protein  42.66 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0314  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.2 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3677  HAD family hydrolase  42.2 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.413497 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3871  HAD family hydrolase  42.2 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4704  HAD hydrolase, IA family  42.2 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3802  HAD hydrolase, IA family  42.86 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0323817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3693  HAD hydrolase, IA family  42.86 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3695  HAD hydrolase, IA family  42.86 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3865  HAD hydrolase, IA family  42.86 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3768  HAD hydrolase, IA family  42.86 
 
 		 222 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3777  HAD hydrolase, IA family  41.74 
 
 		 222 aa  181  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2420  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.06 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.916503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0156  hydrolase  39.9 
 
 		 201 aa  172  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0628  HAD family hydrolase  28.24 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1146  HAD family hydrolase  28.65 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.479676  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0350  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.373549  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1330  HAD family hydrolase  29.77 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.51 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  27.41 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0670  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.94 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.294369 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1951  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.06 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.305812  hitchhiker  0.0035955 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.26 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00251058  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  28.02 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  24.62 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1090  hydrolase  32.69 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  22.82 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  25.62 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.65 
 
 		 280 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0614  HAD family hydrolase  25.76 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  28.22 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0304  HAD-superfamily hydrolase  26.27 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.61412  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  27.12 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2463  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  30.25 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  30.25 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  30.25 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  30.25 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  25.79 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>