141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2910 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 222 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  81.53 
 
 		 222 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  79.73 
 
 		 222 aa  391  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  77.93 
 
 		 222 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  78.38 
 
 		 222 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  79.73 
 
 		 222 aa  384  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  77.03 
 
 		 222 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  75.68 
 
 		 222 aa  374  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  73.64 
 
 		 234 aa  347  9e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  66.36 
 
 		 221 aa  314  6e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  65.32 
 
 		 222 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  65.32 
 
 		 222 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  65.32 
 
 		 222 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  65.32 
 
 		 222 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  65.32 
 
 		 222 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  64.38 
 
 		 221 aa  308  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  61.26 
 
 		 222 aa  308  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  64.09 
 
 		 221 aa  304  6e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  65.61 
 
 		 223 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  63.51 
 
 		 222 aa  300  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  61.43 
 
 		 222 aa  296  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  60.99 
 
 		 222 aa  296  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  58.11 
 
 		 222 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  59.91 
 
 		 222 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  58.11 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2947  haloacid dehalogenase, type II  61.09 
 
 		 224 aa  279  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  58.56 
 
 		 222 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  30.53 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  32.84 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  33.17 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  35.5 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  28.99 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  30.24 
 
 		 242 aa  92.8  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  25.57 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  25.54 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  30.2 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  29.65 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  31.07 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  26.7 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.606287 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  28.71 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  28.71 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  30.73 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  26.44 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  29.08 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  25.25 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  24.55 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  24.11 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  29.95 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.23 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1921  hypothetical protein  25.73 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  31.58 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5007  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  29.58 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25.24 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  34.55 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  32.2 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  26.99 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  22.77 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.41 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  33.88 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.27 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  26.37 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  33.61 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.87 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  25.28 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  31.4 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  28.78 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  27.14 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  31.52 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  26.19 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6165  hydrolase  28.11 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.111596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  23.39 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  26.15 
 
 		 243 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  31.3 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  29.71 
 
 		 236 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  24.1 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  25.76 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  26.32 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  24.1 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  23.11 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  27.6 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  22.91 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  24.35 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  22.96 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  23.08 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  27.8 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  30.43 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  27.08 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  30.77 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  24.02 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  28.32 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  25.94 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  25.94 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  26.07 
 
 		 253 aa  48.5  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  22.03 
 
 		 239 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  25.47 
 
 		 255 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  32.38 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  27.49 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  24.4 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  24.73 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  30.43 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>