143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1547 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 222 aa  465  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  81.08 
 
 		 222 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  79.73 
 
 		 222 aa  384  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  78.83 
 
 		 222 aa  384  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  80.18 
 
 		 222 aa  380  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  75.68 
 
 		 222 aa  370  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  76.13 
 
 		 222 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  74.32 
 
 		 222 aa  358  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  71.23 
 
 		 234 aa  338  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  65.77 
 
 		 222 aa  318  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  65.32 
 
 		 222 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  65.32 
 
 		 222 aa  317  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  63.06 
 
 		 222 aa  317  1e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  65.32 
 
 		 222 aa  315  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  65.32 
 
 		 222 aa  315  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  66.67 
 
 		 221 aa  313  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  64.84 
 
 		 221 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  64.38 
 
 		 221 aa  303  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  63.23 
 
 		 222 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  62.33 
 
 		 222 aa  298  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  62.16 
 
 		 222 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  60.36 
 
 		 222 aa  293  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  61.26 
 
 		 222 aa  292  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  59.46 
 
 		 222 aa  289  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  61.54 
 
 		 223 aa  289  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2947  haloacid dehalogenase, type II  58.82 
 
 		 224 aa  271  4.0000000000000004e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  56.76 
 
 		 222 aa  264  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  31.08 
 
 		 279 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  33.5 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  30.57 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  35 
 
 		 234 aa  98.6  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  33 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  24.31 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  31.86 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  29.68 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  25.54 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  30.19 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  29.29 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  23.45 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  22.32 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  29.65 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  29.47 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  28.02 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.36 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  26.37 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  26.37 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  25.89 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  29.28 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.14 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1921  hypothetical protein  28.3 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5007  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.92 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6165  hydrolase  29.06 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.111596 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  24.08 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  29.76 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  26.58 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  26.13 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  26.13 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25.89 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  26.7 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  27.18 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  28.99 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  27.75 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  26.91 
 
 		 253 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  31.45 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  25.88 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  22.17 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  31.52 
 
 		 229 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  25.14 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  29.29 
 
 		 228 aa  52  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  26.34 
 
 		 253 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  31.71 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  26.34 
 
 		 253 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  26.13 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  26.7 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02361  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_5G14640)  21.95 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  24.19 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  24.19 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.53 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  29.75 
 
 		 253 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1501  hydrolase  43.14 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.401129 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  25.85 
 
 		 229 aa  48.5  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  21.97 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  28.99 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  24.27 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  31.4 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.51 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  27.4 
 
 		 346 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  28.99 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  27.4 
 
 		 346 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  28.99 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  28.99 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.72 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  27.4 
 
 		 336 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  28.99 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  27.78 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  24.84 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  28.86 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  25.26 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>