163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6593 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 222 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  83.78 
 
 		 222 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  82.43 
 
 		 222 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  81.53 
 
 		 222 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  81.53 
 
 		 222 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  80.63 
 
 		 222 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  80.63 
 
 		 222 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  80.63 
 
 		 222 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  74.32 
 
 		 222 aa  350  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  73.42 
 
 		 222 aa  342  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  67.87 
 
 		 221 aa  326  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  61.26 
 
 		 222 aa  301  6.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  61.71 
 
 		 222 aa  298  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  62.16 
 
 		 222 aa  297  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  60.63 
 
 		 221 aa  296  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  60.63 
 
 		 221 aa  294  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  59.46 
 
 		 222 aa  292  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  59.91 
 
 		 222 aa  289  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  59.01 
 
 		 222 aa  288  4e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  59.91 
 
 		 222 aa  287  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  60.27 
 
 		 223 aa  284  7e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  60.09 
 
 		 222 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  57.92 
 
 		 234 aa  279  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  59.17 
 
 		 222 aa  278  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  57.21 
 
 		 222 aa  278  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  57.66 
 
 		 222 aa  277  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2947  haloacid dehalogenase, type II  59.82 
 
 		 224 aa  270  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  30.77 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  30.04 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  32.91 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  31 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  23.04 
 
 		 223 aa  95.1  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  30.63 
 
 		 230 aa  92.8  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  29.69 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  31 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  28.25 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  27.8 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  30.81 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  31.16 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  30.81 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  25.38 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  28.23 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  27.43 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  27.43 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  25.76 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.87 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  28.08 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  27.31 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  26.67 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  29.26 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  26.89 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.31 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  25.32 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  26.9 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  24.46 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1921  hypothetical protein  23.74 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  25.4 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  25.4 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.37 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.732123 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5007  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.14 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  26.38 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  24.87 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  33.07 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  25.68 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  25.12 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  26.32 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  25.12 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.42 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  26.25 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  26.09 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  28.5 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  25.2 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  28.5 
 
 		 316 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  28.5 
 
 		 346 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  28.5 
 
 		 346 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  28.5 
 
 		 344 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  28.5 
 
 		 336 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  24.34 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  24.34 
 
 		 253 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  33.02 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  31.67 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  27.07 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  27.54 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  27.66 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  26.38 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  31.67 
 
 		 149 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  26.87 
 
 		 241 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  27.27 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  31.93 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  24.71 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  23.79 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6150  haloacid dehalogenase, type II  26.29 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  31.37 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  24 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.350775 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>