160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2679 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 
149 aa  300  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  98.66 
 
 
346 aa  298  1e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  98.66 
 
 
346 aa  298  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  98.66 
 
 
336 aa  298  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  98.66 
 
 
316 aa  298  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  98.66 
 
 
344 aa  298  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  98.66 
 
 
240 aa  296  5e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  93.96 
 
 
240 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  77.3 
 
 
240 aa  229  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  71.72 
 
 
240 aa  217  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  69.18 
 
 
240 aa  206  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  67.59 
 
 
242 aa  206  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  66.89 
 
 
240 aa  204  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  67.57 
 
 
266 aa  203  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  67.57 
 
 
266 aa  203  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  67.81 
 
 
252 aa  200  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  67.81 
 
 
266 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  65.07 
 
 
239 aa  194  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  61.49 
 
 
239 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  58.39 
 
 
234 aa  180  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  58.11 
 
 
242 aa  173  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  56.25 
 
 
240 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  54.73 
 
 
242 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  55.41 
 
 
241 aa  168  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  55.7 
 
 
233 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  56.08 
 
 
239 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  62.6 
 
 
203 aa  159  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  62.6 
 
 
203 aa  159  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  54.74 
 
 
233 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  54.74 
 
 
233 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  52.08 
 
 
241 aa  153  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  54.61 
 
 
241 aa  152  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  54.61 
 
 
241 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  52.48 
 
 
240 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  55.8 
 
 
245 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  48.65 
 
 
228 aa  141  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  47.97 
 
 
235 aa  137  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  53.68 
 
 
237 aa  135  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  53.52 
 
 
233 aa  134  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  51.43 
 
 
242 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  50.71 
 
 
233 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  51.43 
 
 
233 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  50.35 
 
 
248 aa  116  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  39.22 
 
 
263 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  40.88 
 
 
232 aa  99.4  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  48.65 
 
 
233 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  37.04 
 
 
227 aa  78.2  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  34.46 
 
 
230 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  33.01 
 
 
234 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  33.01 
 
 
234 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  33.33 
 
 
251 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  32.5 
 
 
247 aa  60.8  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  38.38 
 
 
227 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  32.76 
 
 
222 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  32.76 
 
 
222 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  32.76 
 
 
222 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  32.76 
 
 
222 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  32.76 
 
 
222 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  35.65 
 
 
234 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  35.25 
 
 
240 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  32.08 
 
 
279 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 
228 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  27.52 
 
 
230 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  38.17 
 
 
223 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  32.84 
 
 
231 aa  52.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  30.65 
 
 
225 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0249  HAD superfamily hydrolase  29.85 
 
 
224 aa  52  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  31.67 
 
 
222 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  33.33 
 
 
258 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  33.33 
 
 
253 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  33.33 
 
 
260 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  33.33 
 
 
260 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  33.33 
 
 
267 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  33.33 
 
 
267 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  33.33 
 
 
267 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  33.33 
 
 
267 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  33.33 
 
 
255 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  33.33 
 
 
255 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  29.91 
 
 
224 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  32.38 
 
 
255 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  32.82 
 
 
260 aa  50.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  28.04 
 
 
222 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  31.13 
 
 
270 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  33.01 
 
 
222 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 
222 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  33.64 
 
 
225 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  30.58 
 
 
222 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  31.3 
 
 
226 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  33.01 
 
 
223 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  32.04 
 
 
222 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  31.97 
 
 
226 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  31.87 
 
 
271 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  28.29 
 
 
227 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  33.33 
 
 
223 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175084  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.56 
 
 
223 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  30.95 
 
 
215 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  32.38 
 
 
253 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1995  haloacid dehalogenase, type II  32.38 
 
 
251 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.018403  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  32.74 
 
 
229 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  29.46 
 
 
222 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>