212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2814 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 242 aa  490  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  73.14 
 
 		 242 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  75.11 
 
 		 241 aa  359  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  69.75 
 
 		 239 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  66.81 
 
 		 241 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  53.14 
 
 		 344 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  53.14 
 
 		 346 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  53.14 
 
 		 346 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  53.14 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  53.14 
 
 		 316 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  53.14 
 
 		 336 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  52.12 
 
 		 240 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  46.78 
 
 		 239 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  48.29 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  44.77 
 
 		 242 aa  225  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  47.11 
 
 		 252 aa  224  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  48.95 
 
 		 239 aa  224  8e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  47.64 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  46.69 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  46.25 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  46.25 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  50 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  50 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  47.64 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  48.09 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  45.42 
 
 		 240 aa  215  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  45.92 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  51.28 
 
 		 234 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  49.79 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  45.06 
 
 		 241 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  45.06 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  45.69 
 
 		 240 aa  202  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  54.46 
 
 		 203 aa  198  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  54.46 
 
 		 203 aa  198  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  44.4 
 
 		 240 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  43.59 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  41.2 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  46.15 
 
 		 233 aa  178  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  42.67 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  54.73 
 
 		 149 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  42.51 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  41.45 
 
 		 233 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  40.77 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  40.6 
 
 		 233 aa  158  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  37.28 
 
 		 263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  37.76 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  31.4 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  28.5 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  28.02 
 
 		 234 aa  92  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  29.24 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  51.22 
 
 		 99 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  26.37 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  26.51 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  28.77 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  27.8 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  25.84 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  26.27 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  36.3 
 
 		 227 aa  62  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  27.46 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  28.77 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6581  HAD family hydrolase  26.83 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.413006  normal  0.229645 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  27.14 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  22.11 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  27.14 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  39.05 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  27.8 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  28.1 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6150  haloacid dehalogenase, type II  26.83 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25.51 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  29.63 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  29.63 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  26.44 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  29.17 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  27.23 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  26.47 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  26.34 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  25.96 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  25.53 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  28.03 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  35.58 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  28.03 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  27.5 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  27.67 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  26.96 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  27.19 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  24.77 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  25.94 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  25.5 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  27.2 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  26.38 
 
 		 222 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1510  HAD family hydrolase  24.64 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0822066  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 		 228 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  27.2 
 
 		 222 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  31.74 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3130  haloacid dehalogenase, type II  26.09 
 
 		 224 aa  52  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  23.39 
 
 		 222 aa  52  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  28.94 
 
 		 270 aa  52  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  27.2 
 
 		 222 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  33.33 
 
 		 234 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>