48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2680 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 99 aa  199  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  91.57 
 
 		 240 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  91.57 
 
 		 336 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  91.57 
 
 		 346 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  91.57 
 
 		 344 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  91.57 
 
 		 346 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  91.57 
 
 		 316 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  85.54 
 
 		 240 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  65.79 
 
 		 240 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  65.82 
 
 		 240 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  64.56 
 
 		 240 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  67.61 
 
 		 242 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  63.29 
 
 		 266 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  58.33 
 
 		 240 aa  99.4  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  63.29 
 
 		 266 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  54.76 
 
 		 239 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  62.03 
 
 		 266 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  59.49 
 
 		 252 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  58.23 
 
 		 248 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  60.81 
 
 		 239 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  58.82 
 
 		 240 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  60.56 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  57.33 
 
 		 233 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  57.14 
 
 		 233 aa  80.5  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  49.43 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  48.1 
 
 		 237 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  56.94 
 
 		 242 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  51.22 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  52.11 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  45.57 
 
 		 241 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  54.17 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  52.63 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  48.72 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  44.3 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  47.89 
 
 		 233 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  43.66 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  43.66 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  52.05 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  43.59 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  64.29 
 
 		 234 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  41.77 
 
 		 228 aa  63.9  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  52.17 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  64.18 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  64.18 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  42.22 
 
 		 234 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  36.36 
 
 		 232 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  27.5 
 
 		 242 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  42.22 
 
 		 234 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>