265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0083 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 
234 aa  467  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  99.01 
 
 
203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  99.01 
 
 
203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  76.96 
 
 
239 aa  355  5e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  75.76 
 
 
233 aa  353  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  58.47 
 
 
239 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  59.32 
 
 
346 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  59.32 
 
 
344 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  59.32 
 
 
346 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  59.32 
 
 
336 aa  261  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  59.32 
 
 
316 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  59.32 
 
 
240 aa  261  8e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  58.05 
 
 
240 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  55.79 
 
 
241 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  53.22 
 
 
241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  55.36 
 
 
241 aa  252  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  52.77 
 
 
242 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  58.65 
 
 
245 aa  247  9e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  54.98 
 
 
240 aa  241  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  51.49 
 
 
241 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  52.56 
 
 
235 aa  239  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  51.28 
 
 
242 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  52.74 
 
 
240 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  51.28 
 
 
239 aa  236  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  49.35 
 
 
233 aa  234  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  49.35 
 
 
233 aa  234  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  51.28 
 
 
242 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  55.17 
 
 
237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  51.91 
 
 
240 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  51.93 
 
 
240 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  52.99 
 
 
228 aa  225  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  51.72 
 
 
266 aa  224  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  51.72 
 
 
266 aa  224  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  51.07 
 
 
240 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  51.29 
 
 
266 aa  221  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  50.86 
 
 
252 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  57.14 
 
 
233 aa  220  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  47.23 
 
 
240 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  49.79 
 
 
242 aa  199  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  48.5 
 
 
233 aa  185  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  58.39 
 
 
149 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  46.55 
 
 
233 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  46.98 
 
 
248 aa  176  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  43.1 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  46.12 
 
 
233 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  36.53 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  35.5 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  33.73 
 
 
230 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  28.71 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  29.21 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  64.29 
 
 
99 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  26.61 
 
 
230 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  28.08 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  33.11 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  36.03 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  26.7 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  30.87 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  31.4 
 
 
233 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  26.54 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  25.96 
 
 
227 aa  62.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  26.67 
 
 
297 aa  62  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  26.67 
 
 
243 aa  62.4  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  26.29 
 
 
222 aa  62  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  25.21 
 
 
222 aa  62  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  29.03 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  24.79 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  25.54 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  24.89 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.49 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175084  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  28.95 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  20 
 
 
223 aa  60.1  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  29.73 
 
 
270 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  28.3 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  26.27 
 
 
230 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  27.12 
 
 
253 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  27.5 
 
 
222 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  28.02 
 
 
271 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  32.69 
 
 
222 aa  59.3  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  29.47 
 
 
237 aa  58.9  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  29.95 
 
 
232 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  29.28 
 
 
260 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  34.81 
 
 
223 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  28.09 
 
 
222 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  27.08 
 
 
255 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  28.29 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  31.13 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  31.13 
 
 
222 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3496  haloacid dehalogenase, type II  28.71 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84855  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  30.9 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  27.08 
 
 
255 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0860  haloacid dehalogenase, type II  28.64 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427031  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  31.13 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  31.13 
 
 
222 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  29.95 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  27.08 
 
 
255 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  29.52 
 
 
226 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.13 
 
 
224 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2517  haloacid dehalogenase, type II  30.23 
 
 
227 aa  56.6  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280833  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  33.72 
 
 
235 aa  56.2  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  28.14 
 
 
222 aa  56.2  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>