246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3493 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 237 aa  480  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  77.88 
 
 		 241 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  77.43 
 
 		 241 aa  355  3.9999999999999996e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  70.35 
 
 		 228 aa  324  8.000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  58.59 
 
 		 240 aa  271  8.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  61.21 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  55.79 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  54.27 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  51.71 
 
 		 240 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  50 
 
 		 239 aa  220  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  48.07 
 
 		 241 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  54.31 
 
 		 234 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  53.33 
 
 		 245 aa  217  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  48.92 
 
 		 239 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  48.1 
 
 		 242 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  50.21 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  49.15 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  49.15 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  49.15 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  57.28 
 
 		 203 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  57.28 
 
 		 203 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  50.87 
 
 		 240 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  50.87 
 
 		 346 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  50.87 
 
 		 346 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  50.87 
 
 		 336 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  50.87 
 
 		 316 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  50.87 
 
 		 344 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  47.66 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  48.94 
 
 		 252 aa  208  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  46.98 
 
 		 242 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  53.51 
 
 		 233 aa  207  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  48.94 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  48.92 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  44.83 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  44.83 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  43.1 
 
 		 241 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  44.69 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  46.12 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  43.59 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  49.35 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  44.69 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  46.52 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  45.65 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  44.78 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  36.89 
 
 		 263 aa  135  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  53.68 
 
 		 149 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  35.71 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  36.45 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.71 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  28.02 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  25.73 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  25.73 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  33.17 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  28.74 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0582  haloacid dehalogenase, type II  32.23 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.618635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  29.57 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  32.21 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  32.21 
 
 		 267 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  32.21 
 
 		 267 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  32.21 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  32.21 
 
 		 267 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  32.21 
 
 		 267 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  48.1 
 
 		 99 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1389  haloacid dehalogenase, type II  31.62 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325211  normal  0.752698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  27.95 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  29.41 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  27.98 
 
 		 271 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  26.96 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  26.32 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  31.86 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  30.8 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  29.85 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  29.85 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  29.85 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  25.96 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  24.88 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  30.1 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  28.71 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  28.71 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  28.64 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  28.64 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  28.14 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  26.96 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  30.46 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  38.46 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  26.5 
 
 		 262 aa  62  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3619  haloacid dehalogenase, type II  30.37 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  25.25 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3296  haloacid dehalogenase, type II  30.37 
 
 		 224 aa  62  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  31.53 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  26.85 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  29.59 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5360  haloacid dehalogenase, type II  28.14 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.068509  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  30.81 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1921  hypothetical protein  25.11 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2556  HAD family hydrolase  31.88 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  26.02 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  25.85 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2700  haloacid dehalogenase, type II  27.04 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0174983  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  38.14 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>