199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0447 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 230 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  56.58 
 
 		 227 aa  242  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  36.97 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  36.55 
 
 		 266 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  35.27 
 
 		 266 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  35.27 
 
 		 266 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  35.95 
 
 		 240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  35.95 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  36.97 
 
 		 239 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  32.08 
 
 		 242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  37.93 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  32.04 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  31.72 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  32.37 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  36.36 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  33.73 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  36.45 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  29.25 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  29.25 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  31.66 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  35.45 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  35.45 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  31.36 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  31.16 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  31.36 
 
 		 316 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  31.36 
 
 		 346 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  31.36 
 
 		 346 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  31.36 
 
 		 344 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  31.36 
 
 		 336 aa  99.8  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  33.33 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  31.03 
 
 		 232 aa  98.6  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  30.93 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  30.54 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  32.67 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  29.52 
 
 		 242 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  31.43 
 
 		 239 aa  92  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  32.78 
 
 		 233 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  33.98 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  31.65 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  31.22 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  33.66 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  32.05 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  29.24 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  33 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  28.82 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  28.38 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  32.02 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  31.62 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  27.69 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  34.46 
 
 		 149 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  39.62 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  29.55 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  31.67 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  28.93 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  29.95 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  31.62 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  29.95 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  25.12 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  25.12 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  28.25 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2026  haloacid dehalogenase, type II  29.24 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0563733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2142  haloacid dehalogenase, type II  26.07 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  31.42 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  29.2 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  28.38 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  26.54 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  29.02 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  28.38 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  28.38 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  30.33 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  28.76 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  28.76 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  28.83 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3130  haloacid dehalogenase, type II  32.54 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  25.88 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  31.71 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  25.49 
 
 		 241 aa  62  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3726  haloacid dehalogenase, type II  24.67 
 
 		 228 aa  62  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162438  normal  0.339167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  35 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  30.95 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  26.29 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  26.84 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  26.64 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  36.36 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.81 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  22.78 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  27.45 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  25.65 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  25.54 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  38.83 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  28.77 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  25.68 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0249  HAD superfamily hydrolase  33.02 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  25.13 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  25.85 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  29.86 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  29.86 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  29.86 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  29.86 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  24.22 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>