296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5821 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  100 
 
 		 223 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  87.89 
 
 		 223 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  70.87 
 
 		 224 aa  294  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  66.51 
 
 		 225 aa  278  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  56.5 
 
 		 213 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  31.47 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  37.8 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.42 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  31.74 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  37.38 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  29.35 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.49 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  28.65 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  29.08 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  27.85 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  31.25 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  39.45 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  30.05 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  30.05 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.35 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  28.74 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  30.61 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  28.65 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  27.44 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  28.74 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  26.55 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  30.41 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  30.41 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  26.26 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  25.23 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  26.77 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  30.81 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  27.22 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  29.39 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  27.32 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  27.23 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  27.23 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1452  haloacid dehalogenase, type II  28.21 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0186268  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  26.27 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  30.54 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  28 
 
 		 260 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  25.35 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  40.32 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  27.36 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  32.37 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  29.68 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.91 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  29.06 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  28.87 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  28.37 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  29 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  28 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  26.94 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  26.32 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  26.32 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  27 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  28.21 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  30.09 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  29.74 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  27.43 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  27.64 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  27.64 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  32.68 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  30.56 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0742  beta-phosphoglucomutase  24.73 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  34.96 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  26.11 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  33.64 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2046  haloacid dehalogenase, type II  25.4 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  29.76 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.36 
 
 		 248 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  29 
 
 		 255 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  29 
 
 		 255 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  27.42 
 
 		 247 aa  52  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2128  haloacid dehalogenase, type II  22.82 
 
 		 198 aa  52  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00190875  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  29 
 
 		 255 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  29 
 
 		 253 aa  52  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  37.76 
 
 		 232 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  27 
 
 		 242 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  30.57 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.78 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.15 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0453  haloacid dehalogenase, type II  27.93 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  33.04 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  33.33 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  31.78 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  33.04 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  30.39 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  30.39 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  30.39 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  26.88 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  30.39 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  30.39 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  44.07 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3039  HAD superfamily hydrolase  30.3 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0500536  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  23.29 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1015  hydrolase  23.56 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.772817  hitchhiker  0.000000000927289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>