207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1324 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1324  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 		 240 aa  492  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1029  haloacid dehalogenase, type II  61.67 
 
 		 241 aa  279  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  61.23 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  58.59 
 
 		 237 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3206  haloacid dehalogenase, type II  53.74 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0739  haloacid dehalogenase, type II  55.84 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42181  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  57.08 
 
 		 242 aa  234  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  53.02 
 
 		 239 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0083  haloacid dehalogenase, type II  54.98 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.767236  normal  0.307849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0093  haloacid dehalogenase, type II  56.93 
 
 		 203 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0102  haloacid dehalogenase, type II  56.93 
 
 		 203 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0923081 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  49.15 
 
 		 346 aa  214  8e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  49.15 
 
 		 346 aa  214  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  49.15 
 
 		 344 aa  214  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  49.79 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  49.15 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  49.15 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  49.15 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  48.95 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4220  haloacid dehalogenase, type II  47.86 
 
 		 242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  45.57 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  47.41 
 
 		 241 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  45.49 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  45.49 
 
 		 266 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  48.09 
 
 		 240 aa  205  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  46.03 
 
 		 240 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  45.89 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  45.89 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  47.01 
 
 		 240 aa  204  7e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0508  haloacid dehalogenase, type II  48.51 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0228305  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  45.69 
 
 		 242 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  44.67 
 
 		 266 aa  201  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  44.77 
 
 		 240 aa  201  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  44.67 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  46.38 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  45.69 
 
 		 242 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  46.58 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1791  HAD family hydrolase  46.51 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0351964 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1485  haloacid dehalogenase, type II  46.31 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0492  haloacid dehalogenase, type II  41.67 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4408  haloacid dehalogenase, type II  44.16 
 
 		 233 aa  171  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3414  haloacid dehalogenase, type II  42.24 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.392985 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3008  haloacid dehalogenase, type II  45.22 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21479 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5331  haloacid dehalogenase, type II  41.38 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2679  haloacid dehalogenase, type II  52.48 
 
 		 149 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154065  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05830  haloacid dehalogenase, type II (AFU_orthologue; AFUA_2G07750)  38.86 
 
 		 263 aa  129  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.675232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  34.07 
 
 		 227 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  32.67 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  31.67 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  31.22 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  33.93 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  27.27 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  27 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  40.52 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  27.23 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  30.1 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175084  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2680  haloacid dehalogenase, type II  43.59 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202486  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  27.83 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  27.32 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  24.64 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  29.55 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  28.5 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  25.43 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  24.12 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  24.75 
 
 		 224 aa  62  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2025  HAD family hydrolase  27.27 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0440204 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  26.6 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  24.46 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  26.6 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3726  haloacid dehalogenase, type II  24.88 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162438  normal  0.339167 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  26.6 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  26.6 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  26.6 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  26.6 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  29.56 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5821  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  26.77 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544479  normal  0.692522 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  25.68 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1510  HAD family hydrolase  29.72 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0822066  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  36.84 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  32.06 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  25.54 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6150  haloacid dehalogenase, type II  29.72 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  25.94 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  25.94 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  32.82 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0969  HAD family hydrolase  24.35 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  26.56 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  26.42 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  26.42 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  25.94 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  26.73 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  26.47 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  24.12 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  25.13 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  27.4 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  23.15 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  26.5 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  24.58 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3130  haloacid dehalogenase, type II  29.45 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>