136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0056 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  100 
 
 
221 aa  463  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  77.83 
 
 
221 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  77.83 
 
 
221 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  70.85 
 
 
222 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  71.3 
 
 
222 aa  331  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  68.78 
 
 
222 aa  328  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  68.78 
 
 
222 aa  328  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  67.87 
 
 
222 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  67.87 
 
 
222 aa  325  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  67.42 
 
 
222 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  67.42 
 
 
222 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  66.36 
 
 
222 aa  324  6e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  65.45 
 
 
222 aa  321  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  67.58 
 
 
222 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  65.3 
 
 
222 aa  313  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  66.67 
 
 
222 aa  313  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  65.3 
 
 
222 aa  311  2.9999999999999996e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  65.91 
 
 
223 aa  310  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  64.38 
 
 
222 aa  308  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  64.09 
 
 
222 aa  307  8e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  64.09 
 
 
222 aa  305  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  61.99 
 
 
222 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  61.54 
 
 
222 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2947  haloacid dehalogenase, type II  65 
 
 
224 aa  301  4.0000000000000003e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  62.44 
 
 
234 aa  300  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  60.63 
 
 
222 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  57.47 
 
 
222 aa  265  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  31.48 
 
 
279 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  27.19 
 
 
223 aa  105  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  31.05 
 
 
231 aa  99  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  30.73 
 
 
234 aa  91.7  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  31.86 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  27.35 
 
 
230 aa  89  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  27.8 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  30.1 
 
 
235 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  30.65 
 
 
241 aa  85.5  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  30.1 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  31.88 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  27.86 
 
 
266 aa  72  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  29.86 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  29.86 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  26.53 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  24.62 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  29.95 
 
 
232 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  30.32 
 
 
227 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  22.27 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  28.14 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  21.82 
 
 
234 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  27.55 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  29 
 
 
238 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.64 
 
 
241 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  26.46 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  28.67 
 
 
230 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6165  hydrolase  26.83 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.111596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  25.91 
 
 
243 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.43 
 
 
237 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.732123 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.34 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  27.27 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  29.73 
 
 
229 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5600  haloacid dehalogenase, type II  28.37 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2027  haloacid dehalogenase, type II  29.52 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253695  normal  0.218956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1921  hypothetical protein  24.75 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3474  haloacid dehalogenase, type II  31.43 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  26.32 
 
 
227 aa  52.8  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1501  hydrolase  31.18 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.401129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  29.59 
 
 
248 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4315  haloacid dehalogenase, type II  30.95 
 
 
266 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.103346  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4051  haloacid dehalogenase, type II  30.95 
 
 
266 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0223  haloacid dehalogenase, type II  28.37 
 
 
240 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.285633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0962  haloacid dehalogenase, type II  28.37 
 
 
316 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5007  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  28.64 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1404  haloacid dehalogenase, type II  28.37 
 
 
346 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1601  haloacid dehalogenase, type II  28.37 
 
 
346 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.321746  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0260  haloacid dehalogenase, type II  28.37 
 
 
336 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  30.39 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2536  haloacid dehalogenase, type II  28.37 
 
 
344 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  26.44 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  25.96 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  25.96 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 
266 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  33.01 
 
 
231 aa  48.9  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  24.87 
 
 
228 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2563  HAD family hydrolase  31.19 
 
 
256 aa  48.5  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764506  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 
239 aa  48.5  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  25.25 
 
 
234 aa  48.5  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  27.94 
 
 
237 aa  48.1  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  25.96 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1310  haloacid dehalogenase, type II  31.48 
 
 
240 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2128  haloacid dehalogenase, type II  23.04 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00190875  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  31.73 
 
 
256 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  27.94 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  20.67 
 
 
227 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4382  haloacid dehalogenase, type II  26.11 
 
 
233 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2046  haloacid dehalogenase, type II  26.47 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  24.22 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  23.39 
 
 
253 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0809  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4539  haloacid dehalogenase, type II  27.14 
 
 
239 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0366562  normal  0.757002 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0507  haloacid dehalogenase, type II  26.67 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.817391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>