93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5305 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5305  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  100 
 
 
237 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.732123 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5595  HAD family hydrolase  81.86 
 
 
237 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.606287 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5007  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  87.56 
 
 
237 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44842 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5667  2-haloalkanoic acid dehalogenase  72.57 
 
 
239 aa  362  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2913  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  74.15 
 
 
238 aa  353  8.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4962  HAD family hydrolase  66.95 
 
 
266 aa  327  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0536074  normal  0.0487746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1921  hypothetical protein  70.61 
 
 
236 aa  319  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0045  HAD family hydrolase  54.98 
 
 
236 aa  244  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2178  HAD family hydrolase  51.28 
 
 
232 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.392774  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5608  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  51.08 
 
 
241 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3645  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  46.49 
 
 
248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319882  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1510  HAD family hydrolase  44.44 
 
 
237 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0822066  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  42.92 
 
 
243 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6581  HAD family hydrolase  45.73 
 
 
236 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.413006  normal  0.229645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5528  HAD family hydrolase  42.61 
 
 
243 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6150  haloacid dehalogenase, type II  44.87 
 
 
237 aa  185  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2306  HAD family hydrolase  34.91 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945168 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5659  HAD family hydrolase  34.65 
 
 
242 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0901  haloacid dehalogenase, type II  33.77 
 
 
231 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0736  haloacid dehalogenase, type II  31.88 
 
 
223 aa  102  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5662  HAD family hydrolase  32.44 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.604957  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02539  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  29.92 
 
 
297 aa  94.4  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09518  haloalkanoic acid dehalogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14460)  29.51 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  28.81 
 
 
230 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0250  HAD family hydrolase  32.86 
 
 
223 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204333  normal  0.0355708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1918  2-haloacid halidohydrolase IVA  30.7 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0286  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5903  haloacid dehalogenase, type II  27.75 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0774  HAD family hydrolase  26.63 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.59732 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6092  haloacid dehalogenase, type II  27.14 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.350061  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6682  haloacid dehalogenase, type II  29.65 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6447  haloacid dehalogenase, type II  29.65 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.868203  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6279  haloacid dehalogenase, type II  29.15 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138045  normal  0.720875 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5674  haloacid dehalogenase, type II  25.78 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.799696  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6351  haloacid dehalogenase, type II  29.15 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6055  haloacid dehalogenase, type II  29.15 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0247  haloacid dehalogenase, type II  30.3 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5670  haloacid dehalogenase type II  26.07 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  30.5 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5598  haloacid dehalogenase, type II  27.01 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.789789 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4968  haloacid dehalogenase, type II  26.52 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834572  normal  0.042093 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1493  HAD family hydrolase  25.37 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0159  HAD family hydrolase  29.29 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4415  haloacid dehalogenase, type II  28.16 
 
 
222 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5542  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  24.66 
 
 
226 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6593  haloacid dehalogenase, type II  26.37 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.838711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2910  haloacid dehalogenase, type II  25.12 
 
 
222 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5015  haloacid dehalogenase, type II  25.6 
 
 
222 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308174  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1547  haloacid dehalogenase, type II  27.55 
 
 
222 aa  62  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.503697  normal  0.912077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2185  haloacid dehalogenase, type II  28.79 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0056  haloacid dehalogenase, type II  28.71 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423045  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  27.43 
 
 
234 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  27.09 
 
 
235 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5632  haloacid dehalogenase, type II  27.27 
 
 
221 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4737  haloacid dehalogenase, type II  27.5 
 
 
279 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3493  haloacid dehalogenase, type II  24.7 
 
 
237 aa  52  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.017334  normal  0.49554 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3757  haloacid dehalogenase, type II  26.26 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  25.63 
 
 
234 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2814  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 
242 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0540446  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  26.92 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  30.37 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2564  HAD family hydrolase  27.43 
 
 
231 aa  45.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0054388 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  25.21 
 
 
234 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  25.21 
 
 
234 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  24.38 
 
 
233 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  24.38 
 
 
233 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  24.68 
 
 
225 aa  45.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  24.88 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  23.15 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  26.45 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2941  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  26.37 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.608809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  23.65 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2786  haloacid dehalogenase, type II  26.09 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  23.66 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2999  HAD family hydrolase  34.95 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  26.07 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2493  hydrolase  29.7 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  23.15 
 
 
230 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.52 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  22.75 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  28.71 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3706  haloacid dehalogenase, type II  27.1 
 
 
242 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2963  haloacid dehalogenase, type II  24.15 
 
 
241 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  27.69 
 
 
233 aa  42.4  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  23.53 
 
 
228 aa  42.4  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6883  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
219 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  26.73 
 
 
234 aa  42  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  25.83 
 
 
225 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2498  haloacid dehalogenase, type II  24.52 
 
 
242 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0700401  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  30 
 
 
249 aa  42  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1995  HAD family hydrolase  35.53 
 
 
215 aa  41.6  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.273033 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  22.03 
 
 
242 aa  41.6  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>