244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02344 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02344  Cryptic haloacid dehalogenase 1  100 
 
 		 123 aa  252  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.906915  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  64.66 
 
 		 227 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3956  haloacid dehalogenase, type II  57.76 
 
 		 260 aa  142  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10473  Cryptic haloacid dehalogenase 1  48.74 
 
 		 222 aa  124  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.236103  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00421  Cryptic haloacid dehalogenase 1  44.44 
 
 		 241 aa  121  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2564  haloacid dehalogenase, type II  44.54 
 
 		 253 aa  100  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.332654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0599  haloacid dehalogenase, type II  37.82 
 
 		 225 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.713052 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3130  haloacid dehalogenase, type II  38.05 
 
 		 224 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0968  haloacid dehalogenase, type II  33.88 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314447 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1396  haloacid dehalogenase, type II  32 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.430532  normal  0.787834 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1645  haloacid dehalogenase, type II  38.66 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2026  haloacid dehalogenase, type II  35.04 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0563733 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3515  haloacid dehalogenase, type II  37.82 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.174925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3955  haloacid dehalogenase, type II  33.93 
 
 		 226 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0530  haloacid dehalogenase, type II  29.41 
 
 		 229 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5186  haloacid dehalogenase, type II  29.41 
 
 		 229 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.828389  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5153  haloacid dehalogenase, type II  32.17 
 
 		 228 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3868  haloacid dehalogenase, type II  33.93 
 
 		 226 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  33.93 
 
 		 226 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2142  haloacid dehalogenase, type II  31.62 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000781607  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0249  HAD superfamily hydrolase  32.17 
 
 		 224 aa  71.2  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0171  haloacid dehalogenase, type II  30.58 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.523643  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5721  haloacid dehalogenase, type II  34.95 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014238 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2254  haloacid dehalogenase, type II  31.9 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00115148  normal  0.719984 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2713  haloacid dehalogenase, type II  34.51 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3570  haloacid dehalogenase, type II  30.43 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0754891  normal  0.0443573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4499  haloacid dehalogenase, type II  29.31 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.191667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2198  haloacid dehalogenase, type II  26.89 
 
 		 230 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4165  haloacid dehalogenase, type II  29.17 
 
 		 239 aa  60.5  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1951  haloacid dehalogenase, type II  28.44 
 
 		 222 aa  60.5  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  31.53 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175084  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1658  haloacid dehalogenase, type II  32.35 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00863248  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2901  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase, HAD superfamily protein  27.12 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1235  haloacid dehalogenase, type II  31.43 
 
 		 232 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.923531 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3726  haloacid dehalogenase, type II  27.73 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162438  normal  0.339167 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1301  haloacid dehalogenase, type II  31.43 
 
 		 232 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0171222  normal  0.0801733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1202  haloacid dehalogenase, type II  30.19 
 
 		 223 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.673793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  35.45 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1768  haloacid dehalogenase, type II  29.47 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0461  haloacid dehalogenase, type II  24.79 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2716  haloacid dehalogenase type II  32.95 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0978  haloacid dehalogenase, type II  33.75 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2700  (S)-2-haloacid dehalogenase  29.57 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1362  putative 2-haloalkanoic acid dehalogenase protein  30.48 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5307  haloacid dehalogenase, type II  27.35 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2083  haloacid dehalogenase, type II  28.95 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1953  haloacid dehalogenase, type II  28.95 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0614  HAD family hydrolase  32.99 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  28.21 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1673  haloacid dehalogenase, type II  32.23 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3098  haloacid dehalogenase, type II  28.7 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.651364  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2046  haloacid dehalogenase, type II  25.71 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1952  HAD family hydrolase  28.45 
 
 		 233 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4679  haloacid dehalogenase, type II  32.14 
 
 		 246 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1648  HAD family hydrolase  26.42 
 
 		 270 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6423  haloacid dehalogenase, type II  32.71 
 
 		 234 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.599394 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4367  haloacid dehalogenase, type II  28.57 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.318125  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2128  haloacid dehalogenase, type II  30.39 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00190875  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.46 
 
 		 230 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2489  haloacid dehalogenase, type II  27.27 
 
 		 271 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154459  hitchhiker  0.000896523 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6135  haloacid dehalogenase, type II  32.71 
 
 		 234 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.35 
 
 		 218 aa  52.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2594  hydrolase  29.17 
 
 		 209 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0447  haloacid dehalogenase, type II  31.53 
 
 		 230 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.399561 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  27.64 
 
 		 216 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1226  haloacid dehalogenase, type II  26.89 
 
 		 253 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.613669  normal  0.177429 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6026  haloacid dehalogenase, type II  27.19 
 
 		 255 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.414052  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2051  haloacid dehalogenase, type II  27.19 
 
 		 255 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.255902  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2517  haloacid dehalogenase, type II  26.05 
 
 		 227 aa  51.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280833  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1371  haloacid dehalogenase, type II  25 
 
 		 262 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.620431  normal  0.802585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3582  haloacid dehalogenase, type II  26.67 
 
 		 255 aa  51.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  26.5 
 
 		 234 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.82 
 
 		 231 aa  52  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3446  haloacid dehalogenase, type II  34.38 
 
 		 266 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.301788 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2070  haloacid dehalogenase, type II  27.19 
 
 		 255 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.421316  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3953  haloacid dehalogenase, type II  35.11 
 
 		 252 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.797127  normal  0.122028 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  26.32 
 
 		 230 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  27.68 
 
 		 231 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3496  haloacid dehalogenase, type II  27.35 
 
 		 224 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.84855  normal  0.416002 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2616  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 260 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0354122  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0304  HAD-superfamily hydrolase  28.28 
 
 		 211 aa  50.8  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.61412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1654  2-haloacid dehalogenase  28.74 
 
 		 251 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1589  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 260 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126144  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3221  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 267 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.726743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2527  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 267 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738925  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2091  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 267 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00337197  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1364  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 267 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0919236  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  32.26 
 
 		 212 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  27.68 
 
 		 231 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2474  haloacid dehalogenase, type II  30 
 
 		 258 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168146  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  27.68 
 
 		 230 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  26.83 
 
 		 216 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1807  HAD superfamily hydrolase  28.28 
 
 		 212 aa  50.1  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1108  haloacid dehalogenase, type II  36.36 
 
 		 241 aa  50.4  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1088  haloacid dehalogenase, type II  27.93 
 
 		 201 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  34.04 
 
 		 233 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  34.04 
 
 		 233 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0108  haloacid dehalogenase, type II  35.23 
 
 		 239 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3998  putative (S)-2-haloacid dehalogenase  37.23 
 
 		 239 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>