116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0477 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0477  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 212 aa  421  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.992519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  62.8 
 
 		 363 aa  258  7e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0942  HAD family hydrolase  57.29 
 
 		 212 aa  232  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000977643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1417  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  51.26 
 
 		 215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49722e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2794  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  51.26 
 
 		 210 aa  198  6e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0916243  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0384  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  44.61 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000618634  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0495  hydrolase  47.76 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2332  HAD superfamily hydrolase  39.7 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000241683  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  30.96 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.55 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25290  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.25 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0218735  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.35 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  29.14 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  30.93 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.56 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.04 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.56 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  30.57 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  26.8 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  30.98 
 
 		 322 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.41 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  31.07 
 
 		 237 aa  51.6  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  31.49 
 
 		 334 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.02 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2784  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.93 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  23.96 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  25.91 
 
 		 233 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.38 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.12 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  26.14 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.86 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  35.53 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  25.13 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.01 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  28.87 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  26.53 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  26.02 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.07 
 
 		 281 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  27.14 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2947  haloacid dehalogenase, type II  34.18 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  30.82 
 
 		 237 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.07 
 
 		 285 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.91 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  31.07 
 
 		 287 aa  45.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  28.02 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  28.02 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  28.49 
 
 		 232 aa  45.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  29.69 
 
 		 272 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  24.87 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  29.69 
 
 		 272 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  31.69 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  28.79 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  28.32 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000204  putative phosphatase YieH  26.74 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.30106  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  26.82 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  22.91 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.32 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  23.81 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  28.85 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  25.84 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  36.92 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  26.82 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  28 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  27.44 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  27.84 
 
 		 252 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.53 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.07 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 252 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  29.23 
 
 		 272 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  23.44 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  27.87 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  21.89 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05938  hypothetical protein  26.49 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  33.16 
 
 		 248 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  29.67 
 
 		 272 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  29.51 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  27.53 
 
 		 263 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.53 
 
 		 263 aa  42.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  40.32 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.53294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  25.12 
 
 		 249 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1114  HAD family hydrolase  24.32 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.35546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  24.1 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  27.84 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.57 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  23.67 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68390  putative hydrolase  25.43 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.024723  normal  0.554415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  27.75 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0422  HAD family hydrolase  23.08 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  27.84 
 
 		 252 aa  42.4  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  27.84 
 
 		 252 aa  42.4  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 		 272 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.98 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  27.84 
 
 		 252 aa  42.4  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0274  HAD family hydrolase  27.22 
 
 		 220 aa  42  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  26.19 
 
 		 241 aa  42.4  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>