161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2256 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  100 
 
 
241 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  47.32 
 
 
212 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  47.55 
 
 
216 aa  194  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  42.45 
 
 
267 aa  156  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  42.47 
 
 
243 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.01 
 
 
233 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  42.45 
 
 
267 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  42.45 
 
 
267 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  42.45 
 
 
267 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  42.45 
 
 
267 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  42.45 
 
 
267 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  42.45 
 
 
267 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  40.09 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.09 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  39.62 
 
 
263 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.62 
 
 
263 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.57 
 
 
263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.82 
 
 
252 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.46 
 
 
267 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.09 
 
 
263 aa  138  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.09 
 
 
263 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.5 
 
 
281 aa  138  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  43.2 
 
 
334 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.8 
 
 
215 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  39.6 
 
 
322 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  38.8 
 
 
215 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.78 
 
 
285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  35.64 
 
 
220 aa  135  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  39.25 
 
 
287 aa  135  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  37.56 
 
 
267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.25 
 
 
215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.67 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  35.36 
 
 
214 aa  125  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  33.86 
 
 
234 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 
234 aa  122  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  31.25 
 
 
213 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.91 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  34.81 
 
 
250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  34.11 
 
 
237 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  36.26 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  34.22 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.82 
 
 
221 aa  115  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.71 
 
 
237 aa  115  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.33 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.15 
 
 
280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.04 
 
 
214 aa  112  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.54 
 
 
243 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.41 
 
 
240 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.69 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.15 
 
 
235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.02 
 
 
249 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.15 
 
 
237 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  33.15 
 
 
229 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.38 
 
 
248 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.8 
 
 
243 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.8 
 
 
234 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.52 
 
 
248 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.52 
 
 
248 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.24 
 
 
249 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.75 
 
 
243 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.27 
 
 
268 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  28.57 
 
 
238 aa  98.2  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  29.44 
 
 
236 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  29.12 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.18 
 
 
220 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.02 
 
 
233 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  28.18 
 
 
237 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  28.02 
 
 
231 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  28.02 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.38 
 
 
217 aa  82  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  29.79 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06325  pyrimidine 5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13470)  27.51 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882261  normal  0.0669048 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  25.21 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  29.44 
 
 
228 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  34.15 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  33.33 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  34.15 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  34.15 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  34.15 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  34.15 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  34.15 
 
 
228 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  28.43 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  28.43 
 
 
240 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42723  predicted protein  26.34 
 
 
202 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  23.56 
 
 
227 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.51 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219512  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.27 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  26.9 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  25.13 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  27.68 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  22.58 
 
 
223 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9879  predicted protein  27.07 
 
 
188 aa  52.4  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.753142  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  26.4 
 
 
228 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  26.37 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  36 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  26.37 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  26.13 
 
 
273 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.67 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.73 
 
 
222 aa  49.3  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  22.51 
 
 
223 aa  48.9  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>