208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0396 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0396  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 223 aa  441  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0577  HAD family hydrolase  56.34 
 
 		 216 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6883  phosphoglycolate phosphatase  57.75 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2329  HAD-superfamily hydrolase  55.14 
 
 		 217 aa  215  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.480139 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3204  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  55.3 
 
 		 215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.78222  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  46.61 
 
 		 219 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1142  HAD family hydrolase  44.34 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  45.7 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2725  HAD-superfamily hydrolase  44.39 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0310  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44.59 
 
 		 222 aa  168  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6763  HAD family hydrolase  45.62 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1995  HAD family hydrolase  45.12 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.273033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4488  HAD family hydrolase  41.7 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2155  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.18 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1941  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.06 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139802  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  40.09 
 
 		 222 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  34.9 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  32.43 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  30.43 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  30.54 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.5 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.23 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  28.67 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.19 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.644028  normal  0.407764 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.5 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  32.17 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  30.43 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  36.15 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  31.29 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  36.15 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  36.15 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  36.15 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  31.47 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  36.15 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  34.27 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  31.29 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  36.23 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  31.29 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  36.15 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  36.15 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  33.09 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  33.08 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  37.68 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  37.68 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  33.08 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  30.5 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  33.09 
 
 		 252 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  28.06 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  34.29 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  36.23 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  33.09 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  33.09 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  31.29 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  33.09 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  35.25 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  35.56 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2336  HAD family hydrolase  47.13 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.509915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  32.33 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  33.83 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  32.17 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  32.37 
 
 		 252 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  28.28 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  29.08 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  33.58 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  26.44 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  35.51 
 
 		 261 aa  52  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  28.28 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  28.28 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  33.82 
 
 		 272 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 		 272 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2221  HAD family hydrolase  33.96 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  33.8 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  33.82 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  35.51 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  32.35 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  31.3 
 
 		 225 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  31.43 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  31.65 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  23.88 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  28.37 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  31.3 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  30.83 
 
 		 272 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  34.29 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  33.09 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  29.91 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  32.84 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>