177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1142 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1142  HAD family hydrolase  100 
 
 		 218 aa  443  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4488  HAD family hydrolase  80.18 
 
 		 219 aa  352  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6763  HAD family hydrolase  83.33 
 
 		 216 aa  349  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2725  HAD-superfamily hydrolase  75.7 
 
 		 224 aa  343  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  75.46 
 
 		 219 aa  336  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0310  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  68.04 
 
 		 222 aa  299  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1941  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  63.78 
 
 		 230 aa  251  7e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139802  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  54.42 
 
 		 220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2155  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  54.05 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1995  HAD family hydrolase  56.45 
 
 		 215 aa  219  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.273033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2329  HAD-superfamily hydrolase  51.2 
 
 		 217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.480139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6883  phosphoglycolate phosphatase  47.85 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0577  HAD family hydrolase  49.27 
 
 		 216 aa  191  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0396  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  44.34 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  45.37 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3204  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  47.66 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.78222  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  32.06 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  32.33 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.79 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  31.06 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  30.3 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  20.67 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  21.68 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  21.68 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  21.15 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  21.24 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  30.58 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  26.44 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  20.67 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  30.69 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  21.63 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  21.39 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0384  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.84 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000618634  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_7222  predicted protein  37.36 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.74166  normal  0.591423 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  28.71 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  28.71 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.26 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.89 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  33.62 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  29.81 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  27.48 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0846  HAD family hydrolase  38.27 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578477  normal  0.241059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0990  HAD family hydrolase  38.27 
 
 		 260 aa  53.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.383042  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  36.63 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  27.93 
 
 		 128 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  40.24 
 
 		 228 aa  52  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  27.21 
 
 		 233 aa  51.6  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  27.65 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  22.66 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  25.76 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  31.07 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  27.18 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  27.18 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.71 
 
 		 250 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.81 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0142  HAD family hydrolase  37.84 
 
 		 254 aa  48.5  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  31.3 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  24.03 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3254  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.85 
 
 		 237 aa  48.5  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1762  HAD superfamily hydrolase  23.98 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0794121  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  24.75 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1687  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.63 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0106556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.93 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  36.96 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  27.45 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2941  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  33 
 
 		 265 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.608809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1592  HAD family hydrolase  50 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.08 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0234  HAD family hydrolase  27.49 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.961854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2974  hydrolase  27.54 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.3 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  30.08 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  34.02 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21780  predicted HAD superfamily hydrolase  37.89 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000727615  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1053  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.41 
 
 		 246 aa  46.2  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.98 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1946  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.185313  normal  0.213914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  28.03 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2294  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 		 233 aa  45.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1620  HAD family hydrolase  42.31 
 
 		 255 aa  45.8  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00220504  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3360  HAD family hydrolase  32.22 
 
 		 251 aa  45.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000863998  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0133  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 		 243 aa  45.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  27.34 
 
 		 230 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  26.73 
 
 		 217 aa  45.4  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30 
 
 		 268 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  28.97 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  28.97 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.65 
 
 		 263 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1134  HAD superfamily hydrolase  36.9 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01740  hypothetical protein  28.47 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  23.94 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0283  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  40 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  30.39 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  29.57 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  33.65 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  28.97 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>