272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0142 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0142  HAD family hydrolase  100 
 
 		 254 aa  523  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1620  HAD family hydrolase  51.54 
 
 		 255 aa  239  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00220504  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2555  HAD family hydrolase  44.22 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0682224  normal  0.0129404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0283  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  43.48 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1045  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  43.4 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2419  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  42.06 
 
 		 257 aa  202  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4161  HAD family hydrolase  41.74 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8074  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  37.85 
 
 		 256 aa  184  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301162  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0846  HAD family hydrolase  39.53 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578477  normal  0.241059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0990  HAD family hydrolase  39.53 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.383042  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1134  HAD superfamily hydrolase  37.55 
 
 		 264 aa  175  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1666  HAD family hydrolase  39.06 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0043  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  35.66 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.58574  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0592  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  37.72 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.866632 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0281  HAD family hydrolase  36.96 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0653  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.451378  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2848  HAD family hydrolase  36.12 
 
 		 257 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.098244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2563  HAD family hydrolase  34.22 
 
 		 265 aa  141  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0324  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  33.47 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.984086 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01170  conserved hypothetical protein  32.61 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2071  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  31.33 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000579427  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3064  hydrolase  31.08 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.852724  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0678  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  32.16 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11249  hypothetical protein  30.21 
 
 		 276 aa  105  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.612516  hitchhiker  0.00590142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0756  HAD family hydrolase  27.85 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795052  normal  0.585902 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1629  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.53 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.792065  normal  0.106855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1914  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.28 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00534341  hitchhiker  0.000838349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1310  HAD family hydrolase  30.24 
 
 		 265 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1037  HAD family hydrolase  30.51 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1083  HAD family hydrolase  30.51 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2221  HAD family hydrolase  29.33 
 
 		 203 aa  99.4  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1254  HAD family sugar phosphatase  30.08 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0106686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2722  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.03 
 
 		 267 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0563  HAD family hydrolase  26.12 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0984026  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1250  HAD family hydrolase  30.68 
 
 		 338 aa  94  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.395408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0599  HAD family hydrolase  26.16 
 
 		 271 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.559582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0612  HAD family hydrolase  26.16 
 
 		 271 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0590  HAD family hydrolase  26.16 
 
 		 271 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1643  HAD family hydrolase  30.25 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  hitchhiker  0.00147879 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1214  HAD family sugar phosphatase  28.69 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000012407  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7446  HAD family hydrolase  24.9 
 
 		 273 aa  89  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3034  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.59 
 
 		 335 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1592  HAD family hydrolase  27.34 
 
 		 266 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1190  UMP phosphatase  25 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114642  hitchhiker  0.000177666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0147  Fis family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.809381  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00632  UMP phosphatase  25.59 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000712953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2962  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.59 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000529801  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0695  UMP phosphatase  25.59 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00424094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00623  hypothetical protein  25.59 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2981  UMP phosphatase  25.59 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00141438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0766  UMP phosphatase  25.59 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000485352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0719  UMP phosphatase  25.59 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000961731  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0700  UMP phosphatase  25.59 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385389  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0576  UMP phosphatase  25.59 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0275278  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0444  HAD family sugar phosphatase  25.43 
 
 		 260 aa  86.3  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163433  normal  0.182428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.16 
 
 		 263 aa  86.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00041725 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2479  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 332 aa  85.9  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5439  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.22 
 
 		 344 aa  85.1  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2581  UMP phosphatase  26.99 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6062  sugar phosphatase of the HAD superfamily-like protein  27.47 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0317  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.1 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.937319  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1513  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.63 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000783822 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2900  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  25.76 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.86 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.338548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25490  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  28.82 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0787  UMP phosphatase  25 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  0.744456 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0800  UMP phosphatase  25 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5096  phosphatase  24.78 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.344211  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0892  HAD superfamily hydrolase  27.31 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.65538  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4668  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  24.78 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.265618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4685  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  24.78 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5101  phosphatase,haloacid dehalogenase family  24.78 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.348234  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13640  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  26.69 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1224  UMP phosphatase  25.74 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387552  normal  0.0757281 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0335  UMP phosphatase  25.94 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00626353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0836  UMP phosphatase  25 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0728  UMP phosphatase  25 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5063  phosphatase,haloacid dehalogenase family  24.78 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0740  UMP phosphatase  25 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  normal  0.752742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2607  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.17 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5102  phosphatase,haloacid dehalogenase family  24.78 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2912  UMP phosphatase  25.52 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141408  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3000  UMP phosphatase  25.52 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3370  HAD family hydrolase  24.58 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109866  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4827  phosphatase  24.34 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00162438  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2757  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.29 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5192  phosphatase  24.34 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.183726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0137  phosphatase,haloacid dehalogenase family  24.34 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.651243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3015  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.67 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.33 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2382  UMP phosphatase  25.43 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0204611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2454  UMP phosphatase  25.43 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.010587  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2166  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.72 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000345894  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2547  UMP phosphatase  25.43 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000020241  normal  0.838797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.6 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.029851  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2099  UMP phosphatase  25.86 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204469  normal  0.749352 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0572  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.75 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.641297  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4780  HAD family hydrolase  24.34 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1898  HAD family hydrolase  28.51 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214064 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1605  UMP phosphatase  25.86 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000109056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>