More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_4161 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_4161  HAD family hydrolase  100 
 
 		 255 aa  503  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2555  HAD family hydrolase  55.87 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0682224  normal  0.0129404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0283  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  50.62 
 
 		 253 aa  225  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1045  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  46.99 
 
 		 261 aa  221  7e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8074  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  43.87 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301162  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0142  HAD family hydrolase  41.74 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0846  HAD family hydrolase  42.11 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578477  normal  0.241059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0990  HAD family hydrolase  42.11 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.383042  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0281  HAD family hydrolase  44.03 
 
 		 258 aa  187  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1620  HAD family hydrolase  44.25 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00220504  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0653  HAD family hydrolase  40 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.451378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1666  HAD family hydrolase  44.84 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0592  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  43.65 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.866632 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0043  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  41.35 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.58574  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2848  HAD family hydrolase  38.84 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.098244 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2419  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  40 
 
 		 257 aa  162  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0324  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  39.68 
 
 		 268 aa  162  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.984086 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01170  conserved hypothetical protein  37.37 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1134  HAD superfamily hydrolase  37.75 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2563  HAD family hydrolase  38.12 
 
 		 265 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2221  HAD family hydrolase  38.91 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0678  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  37.17 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2071  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  37.65 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000579427  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0756  HAD family hydrolase  34.98 
 
 		 271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795052  normal  0.585902 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3064  hydrolase  36 
 
 		 259 aa  125  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.852724  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0599  HAD family hydrolase  35.9 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.559582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0612  HAD family hydrolase  35.9 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0590  HAD family hydrolase  35.9 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11249  hypothetical protein  35.32 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.612516  hitchhiker  0.00590142 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1629  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  35.09 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.792065  normal  0.106855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0147  Fis family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 271 aa  116  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.809381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  36.96 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.029851  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1592  HAD family hydrolase  35.19 
 
 		 266 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3370  HAD family hydrolase  31.87 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109866  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4181  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  31.37 
 
 		 260 aa  89.7  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.646523  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0794  HAD family hydrolase  29.84 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1310  HAD family hydrolase  33.48 
 
 		 265 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1760  HAD family hydrolase  30.68 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0798453  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2722  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.39 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1250  HAD family hydrolase  33.62 
 
 		 338 aa  82.4  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.395408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1914  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.6 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00534341  hitchhiker  0.000838349 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0089  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.74 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1911  HAD-superfamily hydrolase  31.62 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0615  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.52 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1837  phosphoglycolate phosphatase  29.84 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1190  UMP phosphatase  28.46 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114642  hitchhiker  0.000177666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2196  HAD family hydrolase  28.79 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2698  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.43 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182106  normal  0.0745775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1643  HAD family hydrolase  32.23 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  hitchhiker  0.00147879 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7446  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0563  HAD family hydrolase  25.6 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0984026  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0656  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.69 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0740  UMP phosphatase  26.94 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  normal  0.752742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0787  UMP phosphatase  26.94 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  0.744456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15000  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  29.15 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.039649  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0800  UMP phosphatase  26.94 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34110  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  30.4 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.800157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0728  UMP phosphatase  26.94 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0836  UMP phosphatase  26.94 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00632  UMP phosphatase  26.94 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000712953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2962  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.94 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000529801  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0695  UMP phosphatase  26.94 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00424094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2981  UMP phosphatase  26.94 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00141438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0719  UMP phosphatase  26.94 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000961731  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0766  UMP phosphatase  26.94 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000485352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0576  UMP phosphatase  26.94 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0275278  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0700  UMP phosphatase  26.94 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385389  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00623  hypothetical protein  26.94 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1037  HAD family hydrolase  28.22 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3889  HAD family hydrolase  29.44 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0444  HAD family sugar phosphatase  27.09 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163433  normal  0.182428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0335  UMP phosphatase  27.87 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00626353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1083  HAD family hydrolase  28.22 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0039  HAD family sugar phosphatase  24.15 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2607  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.76 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1975  HAD family hydrolase  28.63 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2021  HAD family hydrolase  28.63 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3000  UMP phosphatase  27.27 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161111  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2912  UMP phosphatase  27.27 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141408  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3145  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.88 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1955  HAD family hydrolase  28.63 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.84 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11708  phosphatase  29.88 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.900168  normal  0.127356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2194  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.84 
 
 		 259 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07430  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  29.22 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.0830184 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0515  HAD family hydrolase  25.5 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0513  HAD family hydrolase  27.04 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.227881 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1224  UMP phosphatase  25.31 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387552  normal  0.0757281 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3248  HAD family hydrolase  28.29 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3022  HAD family hydrolase  27.91 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.446988  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1242  HAD family hydrolase  28.63 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.319101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2757  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.12 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3015  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.92 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3221  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.91 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0469  HAD family hydrolase  23.14 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4163  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.84 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.81021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1898  HAD family hydrolase  30.68 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214064 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2013  hypothetical protein  28.46 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106645  hitchhiker  0.00617633 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1254  HAD family sugar phosphatase  26.45 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0106686  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3261  HAD family hydrolase  27.86 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>