More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0147 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0147  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 
271 aa  549  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.809381  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0756  HAD family hydrolase  93.36 
 
 
271 aa  523  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795052  normal  0.585902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0599  HAD family hydrolase  84.87 
 
 
271 aa  474  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.559582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0612  HAD family hydrolase  84.87 
 
 
271 aa  474  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0590  HAD family hydrolase  84.87 
 
 
271 aa  474  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11249  hypothetical protein  67.55 
 
 
276 aa  350  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.612516  hitchhiker  0.00590142 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0678  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  50.57 
 
 
264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0653  HAD family hydrolase  31.7 
 
 
257 aa  159  6e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.451378  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0846  HAD family hydrolase  32.59 
 
 
260 aa  155  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578477  normal  0.241059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0990  HAD family hydrolase  32.59 
 
 
260 aa  155  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.383042  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1134  HAD superfamily hydrolase  33.21 
 
 
264 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2848  HAD family hydrolase  30.74 
 
 
257 aa  141  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.098244 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2555  HAD family hydrolase  35.17 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0682224  normal  0.0129404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4161  HAD family hydrolase  35.04 
 
 
255 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2419  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  32.45 
 
 
257 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0281  HAD family hydrolase  30.94 
 
 
258 aa  129  6e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2563  HAD family hydrolase  30.08 
 
 
265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0324  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  30.42 
 
 
268 aa  123  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.984086 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0043  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  32.49 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.58574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0283  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  31.6 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2071  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  30.45 
 
 
266 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000579427  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2757  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.62 
 
 
266 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0592  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  31.43 
 
 
262 aa  105  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.866632 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00632  UMP phosphatase  30.48 
 
 
250 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000712953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2962  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.48 
 
 
250 aa  104  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000529801  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1911  HAD-superfamily hydrolase  29.1 
 
 
258 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0766  UMP phosphatase  30.48 
 
 
250 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000485352  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00623  hypothetical protein  30.48 
 
 
250 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0700  UMP phosphatase  30.48 
 
 
250 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385389  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0576  UMP phosphatase  30.48 
 
 
250 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0275278  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0719  UMP phosphatase  30.48 
 
 
250 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000961731  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0695  UMP phosphatase  30.48 
 
 
250 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00424094  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2221  HAD family hydrolase  28.95 
 
 
203 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2981  UMP phosphatase  30.48 
 
 
250 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00141438  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3145  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.66 
 
 
257 aa  102  9e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1620  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.92 
 
 
259 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0728  UMP phosphatase  29.74 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0800  UMP phosphatase  29.74 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0836  UMP phosphatase  29.74 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0787  UMP phosphatase  29.74 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  0.744456 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1242  HAD family hydrolase  28.9 
 
 
268 aa  99.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.319101  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0740  UMP phosphatase  29.74 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  normal  0.752742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1666  HAD family hydrolase  32.35 
 
 
259 aa  99.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0142  HAD family hydrolase  26.16 
 
 
254 aa  99  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4163  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.14 
 
 
259 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.81021  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0515  HAD family hydrolase  26.97 
 
 
276 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.42 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2196  HAD family hydrolase  29.07 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1190  UMP phosphatase  29.92 
 
 
250 aa  96.3  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114642  hitchhiker  0.000177666 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1224  UMP phosphatase  29.37 
 
 
250 aa  96.3  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387552  normal  0.0757281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3889  HAD family hydrolase  29.23 
 
 
301 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35270  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  28.96 
 
 
257 aa  95.9  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8074  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  27.92 
 
 
256 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301162  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1045  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  29.17 
 
 
261 aa  95.9  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1898  HAD family hydrolase  32.76 
 
 
340 aa  95.5  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000214064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0089  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.28 
 
 
257 aa  94  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2698  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.99 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182106  normal  0.0745775 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0656  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.59 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2607  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.74 
 
 
269 aa  92.8  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.988604 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0794  HAD family hydrolase  28.19 
 
 
257 aa  92.8  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0335  UMP phosphatase  28.84 
 
 
248 aa  92.8  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00626353  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1975  HAD family hydrolase  28.29 
 
 
257 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3000  UMP phosphatase  28.62 
 
 
250 aa  92  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2021  HAD family hydrolase  28.29 
 
 
257 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2912  UMP phosphatase  28.62 
 
 
250 aa  92  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141408  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2752  phosphoglycolate phosphatase  27.31 
 
 
268 aa  92  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6302  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIA  27 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1620  HAD family hydrolase  23.35 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00220504  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1955  HAD family hydrolase  28.29 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4181  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.19 
 
 
260 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.646523  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1513  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.14 
 
 
329 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000783822 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3498  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.57 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.622356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34110  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  27.03 
 
 
264 aa  90.1  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.800157  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2187  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  24.35 
 
 
259 aa  90.1  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0794654  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0839  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.03 
 
 
263 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.41 
 
 
262 aa  89  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.28866  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0615  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.41 
 
 
262 aa  88.6  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1037  HAD family hydrolase  26.05 
 
 
259 aa  88.6  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2194  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.85 
 
 
259 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48021  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3064  hydrolase  26.3 
 
 
259 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.852724  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1511  UMP phosphatase  27.65 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000195754  normal  0.444742 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1083  HAD family hydrolase  26.05 
 
 
259 aa  87.8  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1629  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.1 
 
 
272 aa  87.8  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.792065  normal  0.106855 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2581  UMP phosphatase  25.77 
 
 
248 aa  87  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1837  phosphoglycolate phosphatase  26.92 
 
 
259 aa  87  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4736  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.64 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2722  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  23.6 
 
 
267 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3221  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.87 
 
 
263 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2099  UMP phosphatase  26.52 
 
 
248 aa  85.9  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204469  normal  0.749352 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1514  HAD family hydrolase  28.9 
 
 
330 aa  85.5  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4827  phosphatase  24.81 
 
 
254 aa  85.5  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00162438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5192  phosphatase  24.81 
 
 
254 aa  85.5  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.183726  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2424  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.41 
 
 
257 aa  85.1  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.22995 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2382  UMP phosphatase  26.14 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0204611  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4685  4-nitrophenylphosphatase (p-nitrophenylphosphate phosphohydrolase)  24.43 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109873  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1760  HAD family hydrolase  26.64 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0798453  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1594  UMP phosphatase  25.38 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000808476  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5063  phosphatase,haloacid dehalogenase family  24.43 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2454  UMP phosphatase  26.14 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.010587  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5102  phosphatase,haloacid dehalogenase family  24.43 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>