248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0678 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0678  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  100 
 
 		 264 aa  526  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0756  HAD family hydrolase  51.7 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.795052  normal  0.585902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0599  HAD family hydrolase  52.08 
 
 		 271 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.559582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0612  HAD family hydrolase  52.08 
 
 		 271 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0590  HAD family hydrolase  52.08 
 
 		 271 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11249  hypothetical protein  50.75 
 
 		 276 aa  255  5e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.612516  hitchhiker  0.00590142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0147  Fis family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 271 aa  255  5e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.809381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0653  HAD family hydrolase  32.3 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.451378  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0846  HAD family hydrolase  34.6 
 
 		 260 aa  152  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578477  normal  0.241059 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0990  HAD family hydrolase  34.6 
 
 		 260 aa  152  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.383042  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1134  HAD superfamily hydrolase  35.25 
 
 		 264 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0281  HAD family hydrolase  33.46 
 
 		 258 aa  139  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0283  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  39.13 
 
 		 253 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2419  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  35.57 
 
 		 257 aa  139  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2555  HAD family hydrolase  36.24 
 
 		 260 aa  138  7.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0682224  normal  0.0129404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4161  HAD family hydrolase  37.17 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2071  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  36.33 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000579427  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0324  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  34.22 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.984086 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0043  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  32.76 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.58574  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2848  HAD family hydrolase  31.18 
 
 		 257 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.098244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2563  HAD family hydrolase  31.23 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1045  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  32.6 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1620  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  33.2 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1666  HAD family hydrolase  33.62 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.307803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2221  HAD family hydrolase  36 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0142  HAD family hydrolase  32.16 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0592  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  34.5 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.866632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1975  HAD family hydrolase  31.75 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2021  HAD family hydrolase  31.75 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8074  HAD-superfamily subfamily IIA hydrolase like protein  31.17 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301162  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2196  HAD family hydrolase  31.62 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3145  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.08 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2757  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.48 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2424  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.04 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.22995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1955  HAD family hydrolase  31.35 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35270  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  29.88 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4163  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.84 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.81021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3498  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.29 
 
 		 261 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.622356  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4181  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.25 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.646523  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1242  HAD family hydrolase  31.68 
 
 		 268 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.319101  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00632  UMP phosphatase  30.09 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000712953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2962  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  30.09 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000529801  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00623  hypothetical protein  30.09 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0695  UMP phosphatase  30.09 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00424094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0719  UMP phosphatase  30.09 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000961731  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2981  UMP phosphatase  30.09 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00141438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0576  UMP phosphatase  30.09 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0275278  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0656  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.06 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0700  UMP phosphatase  30.09 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000385389  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0766  UMP phosphatase  30.09 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000485352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3064  hydrolase  28.3 
 
 		 259 aa  95.9  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.852724  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15000  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  28.08 
 
 		 276 aa  95.5  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.039649  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.8 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1911  HAD-superfamily hydrolase  28.74 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0089  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.2 
 
 		 257 aa  94.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0473  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.23 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.28866  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2912  UMP phosphatase  29.41 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00141408  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3000  UMP phosphatase  29.41 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.161111  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1620  HAD family hydrolase  27.39 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00220504  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0836  UMP phosphatase  29.2 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0787  UMP phosphatase  29.2 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal  0.744456 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0800  UMP phosphatase  29.2 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0740  UMP phosphatase  29.2 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  normal  0.752742 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0728  UMP phosphatase  29.2 
 
 		 250 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0335  UMP phosphatase  29.41 
 
 		 248 aa  93.2  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00626353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2194  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.29 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1190  UMP phosphatase  28.63 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114642  hitchhiker  0.000177666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34110  predicted sugar phosphatase of HAD superfamily  30.59 
 
 		 264 aa  92.4  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.800157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0839  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  27.09 
 
 		 263 aa  92  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1224  UMP phosphatase  28.79 
 
 		 250 aa  92  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.387552  normal  0.0757281 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0615  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.34 
 
 		 262 aa  92  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3248  HAD family hydrolase  29.13 
 
 		 259 aa  92  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4736  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.85 
 
 		 275 aa  92  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1914  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.79 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00534341  hitchhiker  0.000838349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3022  HAD family hydrolase  28.35 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.446988  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2698  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  28.2 
 
 		 261 aa  90.1  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182106  normal  0.0745775 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1629  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.21 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.792065  normal  0.106855 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0544  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  29.53 
 
 		 261 aa  89.7  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0515  HAD family hydrolase  26.44 
 
 		 276 aa  89  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2752  phosphoglycolate phosphatase  25.1 
 
 		 268 aa  89  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3643  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.46 
 
 		 261 aa  88.6  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0233  HAD family hydrolase  25.3 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3889  HAD family hydrolase  27.17 
 
 		 301 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0572  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.641297  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1760  HAD family hydrolase  28.46 
 
 		 269 aa  86.7  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0798453  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0794  HAD family hydrolase  28.35 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7446  HAD family hydrolase  25.48 
 
 		 273 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1037  HAD family hydrolase  26.19 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1083  HAD family hydrolase  26.19 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2722  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  25.48 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.46 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6302  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIA  28.46 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2968  HAD family hydrolase  29.21 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0800557  normal  0.179686 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1790  HAD family hydrolase  25.88 
 
 		 277 aa  82.4  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1837  phosphoglycolate phosphatase  24.41 
 
 		 259 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2953  HAD family hydrolase  28.84 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.361868  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1214  HAD family sugar phosphatase  26.77 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000012407  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2997  HAD family hydrolase  28.84 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411928  normal  0.553212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3221  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA  26.36 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0563  HAD family hydrolase  26.81 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0984026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>